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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 试剂盒提微生物DNA溶液使用错误
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suslynyyy

新虫 (初入文坛)

[求助] 试剂盒提微生物DNA溶液使用错误 已有1人参与

想请问一下大家，我们第一次做微生物的工作，使用MP的试剂盒提DNA 时，里面的SEWS-M是浓缩形的，需要稀释100ml乙醇使用。但是没有稀释使用，后来了解到这个是去蛋白用的。所有导致这批样品的260/280普遍都在4-7左右，也有俩个到8的，一个到10的。后续会送的测序公司做扩增子，测微生物群落。请问现在有什么补救的方法、还是这样送到测序公司公司有办法处理？
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1楼 2025-03-19 21:54:09
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小冀-

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【答案】应助回帖

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suslynyyy: 金币+3 2025-03-20 09:49:45
suslynyyy: 金币+2 2025-03-20 21:09:57
我觉得你最好重新做。提取完的体积比较少，处理的话浓度会降低不少，也不一定能得到高质量的dna。如果只是普通pca扩增的话，比较简单，可以试试效果，如果做扩增子，风险有点大，如果测序或者分析结果有问题，这部分损失估计要你自己承担了，公司估计不会管这些
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···
2楼2025-03-20 09:20:07
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suslynyyy

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小冀- at 2025-03-20 09:20:07
我觉得你最好重新做。提取完的体积比较少，处理的话浓度会降低不少，也不一定能得到高质量的dna。如果只是普通pca扩增的话，比较简单，可以试试效果，如果做扩增子，风险有点大，如果测序或者分析结果有问题，这部分 ...

那您好请问一下，如果样品没了，现在有什么办法可以自己去一道蛋白呢。送去只测群落结构，测序公司和我说的是有办法处理，他们能处理好嘛？
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3楼2025-03-20 10:11:28
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小冀-

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很早之前我们如果提取的时候有污染，都是跑胶重提一下，现在可能有其他办法吧，可以问问方法和效果，如果都是常规操作了，应该没问题
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4楼2025-03-20 14:58:59
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suslynyyy

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小冀- at 2025-03-20 14:58:59
很早之前我们如果提取的时候有污染，都是跑胶重提一下，现在可能有其他办法吧，可以问问方法和效果，如果都是常规操作了，应该没问题

主要是没样品了
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5楼2025-03-20 21:09:34
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小冀-

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引用回帖:
5楼: Originally posted by suslynyyy at 2025-03-20 21:09:34
主要是没样品了...

我们当时样本也是不够了，是把提取液跑胶纯化。会有损失，但是指标能正常点。你可以问问公司是不是也是跑胶或者磁珠纯化，如果是，应该没问题
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6楼2025-03-21 09:18:05
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