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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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suslynyyy

新虫 (初入文坛)

[求助] 试剂盒提微生物DNA溶液使用错误 已有1人参与

想请问一下大家,我们第一次做微生物的工作,使用MP的试剂盒提DNA 时,里面的SEWS-M是浓缩形的,需要稀释100ml乙醇使用。但是没有稀释使用,后来了解到这个是去蛋白用的。所有导致这批样品的260/280普遍都在4-7左右,也有俩个到8的,一个到10的。后续会送的测序公司做扩增子,测微生物群落。请问现在有什么补救的方法、还是这样送到测序公司公司有办法处理?
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小冀-

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【答案】应助回帖

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suslynyyy: 金币+3 2025-03-20 09:49:45
suslynyyy: 金币+2 2025-03-20 21:09:57
我觉得你最好重新做。提取完的体积比较少,处理的话浓度会降低不少,也不一定能得到高质量的dna。如果只是普通pca扩增的话,比较简单,可以试试效果,如果做扩增子,风险有点大,如果测序或者分析结果有问题,这部分损失估计要你自己承担了,公司估计不会管这些
···
2楼2025-03-20 09:20:07
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suslynyyy

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小冀- at 2025-03-20 09:20:07
我觉得你最好重新做。提取完的体积比较少,处理的话浓度会降低不少,也不一定能得到高质量的dna。如果只是普通pca扩增的话,比较简单,可以试试效果,如果做扩增子,风险有点大,如果测序或者分析结果有问题,这部分 ...

那您好请问一下,如果样品没了,现在有什么办法可以自己去一道蛋白呢。送去只测群落结构,测序公司和我说的是有办法处理,他们能处理好嘛?
3楼2025-03-20 10:11:28
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小冀-

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很早之前我们如果提取的时候有污染,都是跑胶重提一下,现在可能有其他办法吧,可以问问方法和效果,如果都是常规操作了,应该没问题
···
4楼2025-03-20 14:58:59
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suslynyyy

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小冀- at 2025-03-20 14:58:59
很早之前我们如果提取的时候有污染,都是跑胶重提一下,现在可能有其他办法吧,可以问问方法和效果,如果都是常规操作了,应该没问题

主要是没样品了
5楼2025-03-20 21:09:34
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小冀-

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引用回帖:
5楼: Originally posted by suslynyyy at 2025-03-20 21:09:34
主要是没样品了...

我们当时样本也是不够了,是把提取液跑胶纯化。会有损失,但是指标能正常点。你可以问问公司是不是也是跑胶或者磁珠纯化,如果是,应该没问题
···
6楼2025-03-21 09:18:05
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