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小慌不张

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求助:请问有人用Gaussian算过金属卟啉吗 已有2人参与

请问有人用Gaussian算过金属卟啉的能级吗,我原本的目的是用ChemDraw画出金属卟啉钯的结构,转成3D结构,然后放到Gaussian里面算能级,但现在3D结构很奇怪,高斯里面也找不到PdTFPP对应的基组,C、N、H一般使用6-31G
文献说卟啉环是平面四吡咯大环,但是我将ChemDraw素材库里面的卟啉转换为3D结构后,球棍模型是扭曲的,不在一个平面。再加入一个金属原子,结构更歪七扭八的更奇怪了。

(救命,上传不了图片,按交流贴说的用了flash,依然不行)。
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paramecium86

版主 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小慌不张 at 2025-01-09 23:04:22
你好,谢谢,请问GV是什么软件呀,没有搜到,因为我不是算高斯的那个人,我是画了PdTFPP的结构给别的同学算,他说我的结构转成3D不在一个平面,非常奇怪,但是他也是才学高斯,也不熟悉
...

GaussView
是高斯配套的可视化。
4楼2025-01-10 16:51:19
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
卟啉自己在GV里画也不是太费劲。如果实在不习惯用GV 那或者找其他算过包含卟啉的机理的文章里的SI给弄出来卟啉的结构。都未必是完全一样的 有个骨架弄出来改改就业很简单。基组当然有适配的比如 6-31G* (这个极化基组一定要加 否则结果太差)  不要用GV里自带的。那里面太少。真正用高斯做计算肯定是自己写输入文件和关键词。并且看高斯的说明书里提到的有什么基组是支持的。不要就看GV里面列出来那区区几个基组。高斯相关的教程也是多入牛毛了。查查就有。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2024-12-26 12:28:05
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小慌不张

铁虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2024-12-26 12:28:05
卟啉自己在GV里画也不是太费劲。如果实在不习惯用GV 那或者找其他算过包含卟啉的机理的文章里的SI给弄出来卟啉的结构。都未必是完全一样的 有个骨架弄出来改改就业很简单。基组当然有适配的比如 6-31G* (这个极化基 ...

你好,谢谢,请问GV是什么软件呀,没有搜到,因为我不是算高斯的那个人,我是画了PdTFPP的结构给别的同学算,他说我的结构转成3D不在一个平面,非常奇怪,但是他也是才学高斯,也不熟悉
发自小木虫手机客户端
3楼2025-01-10 12:04:22
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小慌不张

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2025-01-10 16:51:19
GaussView
是高斯配套的可视化。...

好的,谢谢你,我去学习一下
发自小木虫手机客户端
5楼2025-01-15 10:14:32
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