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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】想学计算机辅助药物设计求高人解答
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wanggch123

荣誉版主 (文坛精英)

王版

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

[交流] 【求助】想学计算机辅助药物设计求高人解答

本人是药物化学专业，因为现在CADD在文献上看的很多。
所以想应用这个软件，并不做深入研究。
现在想知道，这个相关的软件可以在一般的PC机上使用吗？（如不能那就算了）
即是不需要花钱买的工作站。
相关的程序都有哪些？那个好些？
有可以下载的程序吗？


基本的问题，如果个人的计算机不能用，那我就可以打消自己这个想法了，就不用浪费时间了。

问题就这些，谢各位解答！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 20:52 ]
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努力奋斗，人生终将辉煌！
1楼 2009-10-27 23:21:08
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★
wanggch123(金币+1):谢谢参与
dongdong3881(金币+2,VIP+0):非常感谢 10-28 13:47
不做深入研究而用CADD软件
如同给一个五岁娃娃一只AK47

大部分软件都可以在PC上运行
绝大部分程序都有盗版，但是你无法在国外期刊发表论文，也无法申请专利（如果无法绕开软件的作用）
软件的质量或者性能：没有最好，只有合适

Tripos Sybyl
Accelrys Discovery Studio
ChemComp Group MOE
Gaussian
GAMESS
Gromacs
NAMD/VMD
DOCK
AutoDock/ADT
iGemDock
GOLD
ArgusLab
Glide
Amber
CHARMm
等
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2楼2009-10-28 01:38:59
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烽烟1056

新虫 (小有名气)
★ ★
wanggch123(金币+1):谢谢参与
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 10-31 23:31
其实操作一个对接软件并不难，难的是懂这个软件是怎么完成你的任务的，弄清楚了这个问题才能对不同的体系选择合适的软件。
“软件的质量或者性能：没有最好，只有合适”--很同意
赞一下(11人) 回复此楼
3楼2009-10-29 16:16:52
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
wanggch123(金币+1):谢谢参与
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 10-31 23:31
估计楼主就是为了发文章，都是SCI闹得，急功近利者比比皆是，坏了这个领域的风气，哎。。。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2009-10-30 07:14:10
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★
zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流！ 10-31 15:15
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2009-10-30 07:14:
估计楼主就是为了发文章，都是SCI闹得，急功近利者比比皆是，坏了这个领域的风气，哎。。。

这叫“被CADD”了
英语叫：CADDed
被CADD的人，叫做：CADDeder


[ Last edited by yalefield on 2009-10-30 at 08:50 ]
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5楼2009-10-30 08:48:56
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
恩，老汉让偶长见识了。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
6楼2009-10-31 12:26:30
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wanggch123

荣誉版主 (文坛精英)

王版

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
★
zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流！ 10-31 15:16
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2009-10-30 07:14:
估计楼主就是为了发文章，都是SCI闹得，急功近利者比比皆是，坏了这个领域的风气，哎。。。

发文章并不需要这个玩意。
只是现在药化的文章，绝大部分都有很大的篇幅来说这个方面的东西。
没学过，看起来很是费劲，因此才有念想想学学，以后就看的懂了。
就想我说的，只是用，并不深入研究它！
我们这边有专门搞这个的老师，我懒得搞这方面的文章。
本人只对合成感兴趣！

另，我觉得什么文章都和CADD扯上关系，才真正的坏了这个领域的风气。
不过现在是大势所趋，所有的文章都是这个样子。

[ Last edited by wanggch123 on 2009-10-31 at 12:50 ]
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努力奋斗，人生终将辉煌！
7楼2009-10-31 12:49:08
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nif-hoo

木虫 (正式写手)
★
wanggch123(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009-10-30 08:48:


这叫“被CADD”了
英语叫：CADDed
被CADD的人，叫做：CADDeder


[ Last edited by yalefield on 2009-10-30 at 08:50 ]

活学活用啊~！！
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Whenyoubelieve,somehowyouwill
8楼2009-10-31 18:51:29
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
mingdong(金币+3,VIP+0):精辟！ 10-31 23:23
yjcmwgk(金币+6,VIP+0):这玩意儿不给重奖，那是绝对说不过去了 12-5 17:10
引用回帖:
Originally posted by wanggch123 at 2009-10-31 12:49:

发文章并不需要这个玩意。
只是现在药化的文章，绝大部分都有很大的篇幅来说这个方面的东西。
没学过，看起来很是费劲，因此才有念想想学学，以后就看的懂了。
就想我说的，只是用，并不深入研究它！
我们这 ...

本人只对合成感兴趣！

另，我觉得什么文章都和CADD扯上关系，才真正的坏了这个领域的风气。
不过现在是大势所趋，所有的文章都是这个样子。

楚王好细腰，宫女多饿死。

今天，周济部长卸任了。没听他说过“我只是想找个部长当当，并不想研究怎么当”。
今天，钱学森上校去世了。没听他说过“我只对航天感兴趣”。
其实，每个人都有自己的偏好。
不过，谁能把握好如何处理这种偏好，谁才能更好地发展自己。
如果一个人让自己的偏好给控制了，那他将面临很大的困难。
这也算是俺对中国传统文化“中庸之道”的一种解读。

的确，像JMC，JOC，二十年前并不要求论文中有什么理论计算的部分。

可是，

时代在进步，理论欲作主。
虽然不完善，多用才成熟。
单纯做合成，每周仨产物。
分离带分析，要等下周五。

有了一锅煮，似乎遭嫉妒。
再添组合法，效率打不住。
天天新分子，NCE阿堵。
无奈伴慨叹，为啥受这苦？

CADD滥，不能怨用户。
药化为了啥？为了找幸福。
幸福没找到，大家日难渡。
苦海盼神舟，合成盼神助。

若神真有信，何必炼金术！
科学谆谆嘱，规律自然出，
不靠神仙帝，实践Just Do.
多Do有数据，整理成论著，

合成比思路，理论比用途。
总结获提高，指导今后路。
机理尝解释，预测筛祸福，
低头拉车时，勿忘前行步。

俺爱打酱油，最恨格律束，
灵里追自由，话中寻毙酷。
环肥和燕瘦，各有粉丝煮。
健康最重要，莫说Only you......
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9楼2009-10-31 23:05:19
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wanggch123

荣誉版主 (文坛精英)

王版

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009-10-31 23:05:


楚王好细腰，宫女多饿死。

今天，周济部长卸任了。没听他说过“我只是想找个部长当当，并不想研究怎么当”。
今天，钱学森上校去世了。没听他说过“我只对航天感兴趣”。
其实，每 ...

说的太多了，其实我并不是你所理解的那个意思，既然我都准备学了，那就不是你所理解的意思。并不偏向！
只是楼上有位说，为了发文章，急功近利，看的很不爽。
好像要搞CADD的人都是急功近利的似的。
就我初步的了解看，要把CADD用的熟练的话，是需要不少的时间的，急功近利不得的。
本人只是开始学习而已，那位仁兄也太误解我这学习的初衷了。


我的意思是说，我只对发合成的文章感兴趣，其他类的知识我是会学的，但我却不会发别的方面的文章的。
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努力奋斗，人生终将辉煌！
10楼2009-11-01 00:24:26
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