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望风止水

新虫 (小有名气)

[求助] 大肠杆菌原核表达,破碎后目的蛋白看不到了 已有1人参与

一直在做蛋白的原核表达与纯化,目前遇到的一个问题,不知道大家有何建议?
我们在E.coli BL21(DE3)中做目的基因的克隆表达,过程是:OD值 0.8左右加入IPTG(终浓度0.5mM),25℃诱导24h后取2mL离心取沉淀,加100μL PBS和50μL 上样液煮沸10min,取30μL跑SDS-PAGE。剩余的菌液离心后加入含8M尿素的binding buffer(因为怀疑目的蛋白在包涵体里面),然后超声破碎(200w,工作4S,间隔6S,工作20min)。破碎后13000rpm离心10min,上清保留做SDS-PAGE,沉淀用PBS洗3遍后加入binding buffer,取相同的两管,1管加上样液煮沸10min做SDS-PAGE,1管不煮沸直接做做SDS-PAGE,结果。直接菌液煮沸后看到了比较明显的目的条带(我同时做了2个目的蛋白,1个14 kDa左右,另1个35kDa左右),而后面几个处理的目的条带很弱,基本看不到,不知道怎么回事?
SDS-PAGE的图片请查看链接:
https://pan.baidu.com/s/1OAXXo0UxW8UfisBtNkL5tA?pwd=k861 提取码: k861
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小野说

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

看你胶的背景,应该是上样的目的蛋白量不一致导致的(关注体积和浓度的变化),可以用考马斯亮蓝法或者使用标准品进行定量,或者其他的方法也行;
看你的胶片感觉像是包涵体,你的方法把好多步骤都糅合在一起了,使许多需要单独的步骤的目的变得不可控,建议你采用合适的方法来进行表达定位和后续的相关实验。
6楼2024-09-09 14:44:58
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望风止水

新虫 (小有名气)

SDS-PAGE电泳图,1和2是菌液直接煮沸电泳,3和4是上清,5和6是沉淀煮沸后电泳,7和8是沉淀未煮沸直接电泳
2楼2024-09-05 11:16:28
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yandz680717

木虫 (正式写手)

先测序看看是不是有问题,如果没有问题,考虑是不是稀有密码子,可以转入Rossetta

发自小木虫Android客户端
3楼2024-09-05 15:11:08
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望风止水

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yandz680717 at 2024-09-05 15:11:08
先测序看看是不是有问题,如果没有问题,考虑是不是稀有密码子,可以转入Rossetta

测序没有问题,密码子是经过合成公司优化的
4楼2024-09-05 19:39:18
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