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caozf

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教

各位高手,请问在MS中 如果将两个优化好的分子结构放在一起,将他们分子中的一个原子放在合适的位置,然后在优化,结果他们会成建吗?
   我现在要预测NO2和卟啉分子的紫外吸收光谱,就是首先要优化他们复合物的结构,我不知道哪里出问题了,最后用vamp算出的激发态振动强度全是零。但是我单算卟啉的紫外用这样的方法是可以算出来的。我现在不知道优化复合物的结构时是要让他们成建呢,还是不成键放在合适的位置呢,我不是很清楚。请大家帮助我一下,很急。
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redskywei

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 天棚元帅 at 2009-10-25 08:15:



楼主, 你所说的bond设置只是一种“显示”上的帮助, 也就说同样的距离下, 你可以通过调整bond的范围而让两个原子成键, 也可以让它们不成键, 这只是显示上的问题, 真正成键与否与bond 的设置是没有关系 ...

同意楼上,显示问题哦。
坠入无边的网~~
7楼2009-10-25 10:32:04
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liusanbing

铜虫 (正式写手)


aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-21 20:45
要成键,要不很可能是0
2楼2009-10-21 11:53:05
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caozf

金虫 (小有名气)

我用bulid里的bond 让他们成键,然后再优化,算出来怎么还是零,不知道是什么原因
3楼2009-10-21 17:08:32
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liazhi2008

木虫 (小有名气)


freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢参与~ 10-22 10:11
复合物指的是分子间靠弱相互作用结合在一起,比如氢键,你可以考虑按它们可以形成氢键的位置放,再优化,这样得到的复合物才是你想要的。
4楼2009-10-22 08:02:14
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