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各位高手，请问在MS中 如果将两个优化好的分子结构放在一起，将他们分子中的一个原子放在合适的位置，然后在优化，结果他们会成建吗？ 我现在要预测NO2和卟啉分子的紫外吸收光谱，就是首先要优化他们复合物的结构，我不知道哪里出问题了，最后用vamp算出的激发态振动强度全是零。但是我单算卟啉的紫外用这样的方法是可以算出来的。我现在不知道优化复合物的结构时是要让他们成建呢，还是不成键放在合适的位置呢，我不是很清楚。请大家帮助我一下，很急。 |
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caozf(金币+2,VIP+0): 10-25 09:46
aylayl08(金币+3,VIP+0):感谢耐心解答，欢迎常来 10-25 10:02
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楼主， 你所说的bond设置只是一种“显示”上的帮助， 也就说同样的距离下， 你可以通过调整bond的范围而让两个原子成键， 也可以让它们不成键， 这只是显示上的问题， 真正成键与否与bond 的设置是没有关系的。 在某些情况下， bond值设置偏大， 这样结构优化后的结果中虽然显示是成键的， 但实际上并没有成键。 针对你的问题， 我觉得你可能需要参考些类似的文献， 查出些可供参考的信息， 比如 成键的位置， 成键的大致距离， 然后在MS中给出初始构型， 再进行优化。 希望对你有帮助，呵呵~~ |
6楼2009-10-25 08:15:37
redskywei
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