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小鸡腿a

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因敲除实验求助 已有1人参与

基因敲除实验求助,本人正在做假单胞菌株基因的敲除,利用同源重组的原理构建了上下游同源臂,载体为自杀质粒含SacB基因对蔗糖敏感,已重新构建目的基因上下游至自杀质粒中,利用接合转移或是电转方法在双抗板上筛选出野生菌携带重组质粒。
目的基因是耐药基因,野生菌株是假单胞菌(含有4ug/ml美罗抗性,在10ug/ml四环素也能长,超过20ug/ml四环素不长),使用的自杀质粒是含有SacB基因的pEX18Tc(含有四环素抗性),在单交换这一步尝试过接合转移,也尝试过电转,有时能在双抗板上长出单克隆,有时不能;有一次电转后将双抗板(20ug/ml四环素+4ug/ml美罗)上的出现单克隆进行之字划线后做PCR,概率是120个中出现了2个SacB阳性条带和野生株特异基因条带,将阳性的之字划线再去密涂保种方便后续用蔗糖平板筛选出双交换,但是将密涂保种的菌进行PCR时,SacB阳性条带已经消失了,再去取之字上的菌做PCR时,SacB基因阳性条带也消失了,求助各位大神想知道这是什么原因,为什么出现条带后又消失了,如果正确的话我应该如何将阳性条带进行保种,好不容易出现一次SacB阳性,已经很久没做出这个实验了,我应该如何得到单交换菌株??求助各位大佬们有空时解答!!!
还有一个问题得到单交换菌株后,用无抗性液体培养后稀释1000倍再涂布蔗糖平板,再利用原始野生株包含目的基因上下游片段进行PCR,若敲除成功,则扩增条带将缺少目的基因对应的长度。尝试在10%的蔗糖和15%蔗糖平板上涂布了,37℃温箱培养了18h,再挑取很多个单克隆做的PCR,还是没结果,是否蔗糖平板在37℃温箱培养时间要延长??求助各位大佬们有空时解答!!!
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bbxaibaba

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主,你的问题解决了吗?我也用的相同敲除载体,总是单交换验证出现双条带,双交换都是恢复突变的。。。。
厚积薄发,爱我所爱
2楼2024-07-24 18:54:35
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清醒的瞌睡虫

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bbxaibaba at 2024-07-24 18:54:35
楼主,你的问题解决了吗?我也用的相同敲除载体,总是单交换验证出现双条带,双交换都是恢复突变的。。。。

你好,请问解决问题了吗?双交换总是野生的,求教一下
3楼2025-05-22 16:28:24
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