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chengtao9688木虫 (小有名气)
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[交流]
关于细菌膜蛋白的提取
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请问有哪位大侠做过细菌膜蛋白的提取? [ Last edited by amisking on 2009-10-20 at 12:29 ] |
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一、从新鲜样品中提取总蛋白(简易法) 1、自配裂解液(pH 8.5-9.0):50 mM Tris-HCl,2 mM EDTA, 100 mM NaCl,0.5% Triton X-100,调pH值至8.5-9.0备用;用前加入100 μg/ml 溶菌酶,1μl/ml 的蛋白酶抑制剂PMSF。该裂解液用量为10-50ml 裂解液/1g湿菌体。 2、将40ml 菌液在12000g,4℃下离心15分钟收集菌体,沉淀用PBS悬浮洗涤2遍,沉淀加入1ml裂解液悬浮菌体。 3、超声粉碎,采用300w,10s超声/10s间隔,超声20min,反复冻融超声3次至菌液变清或者变色。 4、1000g离心去掉大碎片,上清可直接变性后PAGE电泳检测,或者用1% SDS溶液透析后冻存。 缺点:Western blotting结果表明,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。 二、从Trizol裂解液中分离总蛋白 1、Trizol溶解的样品研磨破碎后,加氯仿分层,2-8℃下10000g离心15min,上层水相用于RNA提取,体积约为总体积的60%。 2、用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。每使用1ml Trizol加入0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3min,2-8℃不超过2000g离心5min。 3、将上清移至新的EP管中,用异丙醇沉淀蛋白质。每使用1ml Trizol加入1.5ml异丙醇,室温放置10min,2-8℃下12000g离心10min,弃上清。 4、用含有0.3M 盐酸胍的95%乙醇洗涤。每1ml Trizol加入2ml洗液,室温放置20min, 2-8℃下7500g离心5min,弃上清,重复洗涤2次。最后加入2ml无水乙醇,涡旋后室温放置20min,2-8℃下7500g离心5min,弃上清。 5、冷冻干燥5-10min,1%SDS溶液溶解,反复吹打,50℃温浴使其完全溶解,2-8℃下10000g离心10min去除不溶物。 6、替代方案:将3中的酚醇上清液移至小分子量透析袋中,在2-8℃的1% SDS溶液中透析3次,1000g离心10min去除沉淀,上清可直接用于蛋白实验。 三、从新鲜样品中提取疏水性膜蛋白(Triton X-114去污剂法) 1、配制疏水性蛋白提取液(非裂解液):1% Triton X-114,150mM NaCl, 10mM Tris-HCl,1mM EDTA,调pH值至8.0备用。 2、菌液于4℃条件下15000g离心15min收集菌体;用1ml 含有5mM MgCl2 的PBS洗涤3次,最后于4℃条件下15000g离心15min收集菌体。 3、菌体沉淀加入1ml冷提取液,于4℃条件下放置2h,17000g离心10min,去除沉淀取上清。 4、将上述上清中的Triton X-114含量增加到2%,再加入20mM的CaCl2抑制部分蛋白酶活性,37℃条件下放置10min使其分层。室温下1000g离心10min使液相和去污相充分分层。 5、将液相和去污相分开,分别用10倍体积的冷丙酮在冰上沉淀45min。 6、于4℃条件下17000g离心30min,用去离子水洗涤沉淀3次。 7、将沉淀溶解在1% SDS溶液中,测定蛋白浓度,比较液相和去污相中蛋白提取效率,一般是去污相中疏水性膜蛋白较多,适于进一步蛋白实验。 8、SDS-PAGE进一步分析液相和去污相的蛋白图谱。 我们以前就是照这个来的 你看看能不能用 |

4楼2009-10-20 11:58:37
chengtao9688
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分离细菌膜蛋白的方法: ① 于20ml 营养肉汤中过夜培养细菌,37℃,200rpm。 ② 10000g、20min、4℃离心,去上清。 ③ 20ml预冷的Tris-Mg缓冲液重悬,同样条件离心,再重悬于预冷的Tris-Mg缓冲液。 ④ 超声波破碎细菌。 ⑤ 3000g,10min、室温下离心去除未破碎细菌。小心吸取上清(含有胞质成分和细菌外被成分)。 ⑥ 超速离心I:100,000g,60min,4℃,去除上清(胞质成分),收集细菌外被成分。 ⑦ 用10ml含2%的SLS的Tris-Mg 缓冲液重悬沉淀物,室温温育20-30min。 ⑧ 超速离心II:70,000g,60min,室温沉淀收集外膜蛋白,去除上清(含细胞质膜)。重复⑦、⑧两步。 ⑨ 充分吸除上清,并根据沉淀体积大小用0.1-0.2 ml的ddH2O重悬沉淀物。根据公式:蛋白浓度(mg/ml)=1.450 D280-0.740 D260测定外膜蛋白浓度,调节蛋白浓度至40ug/ul,该蛋白质样品-70℃贮存。 试剂 ① Tris-Mg 缓冲液 10mM Tris-Cl 5mM MgCl2 pH 7.3,4℃保存 ② 2%(w/v)十二烷基肌氨酸钠 (SLS) 我们用上面的方法做过,但是在8步以后会形成大量的沉淀,如何溶解沉淀问题?如果加大水量溶解必然会使其浓度降低,跑PAGE时蛋白浓度低,效果较差。请问如何解决此问题? |
5楼2009-10-20 19:54:48
jiaminl
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6楼2009-10-21 16:50:53
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7楼2009-12-06 16:02:33














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