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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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mermaid1128

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】【求助】vasp 并行计算 出错

vasp并行编译通过
mpirun 在其他小 程序上测试能用


运行结果如下:

running on    2 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    2 groups
vasp.4.6.28 25Jul05 complex
POSCAR found :  2 types and    2 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, Vosko type interpolation para-ferro
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: wrap around errors must be expected
FFT: planning ...           1
p1_21314:  p4_error: interrupt SIGSEGV: 11
p0_21310:  p4_error: interrupt SIGSEGV: 11
rm_l_1_21376: (0.570312) net_send: could not write to fd=5, errno = 32
forrtl: error (69): process interrupted (SIGINT)

Stack trace terminated abnormally.
/usr/local/mpich_ifort/bin/mpirun.ch_p4: line 243: 21310 Segmentation fault      /home/ybyuan/p-vasp -p4pg /home/ybyuan/hp/PI21226 -p4wd /home/ybyuan/hp
Command exited with non-zero status 139
0.51user 0.05system 0:00.79elapsed 72%CPU (0avgtext+0avgdata 0maxresident)k
0inputs+0outputs (0major+25012minor)pagefaults 0swaps



请问 各位大侠是 什么问题 ?如何 解决!

十分 感谢!
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2,VIP+0):感谢解答 10-20 19:15
SIGSEGV还是并行的问题,而且还是某个节点有问题。
按照vasp官网的说法,可能是你内存不足了,缩小一下计算量看看吧。
2楼2009-10-20 00:09:20
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mermaid1128

木虫 (著名写手)

版主 你好

以下是 我的OUTCAR
......
k-point 30 :  0.3750-.12500.3750  plane waves:   5194
k-point 31 :  -.3750-.12500.3750  plane waves:   5194
k-point 32 :  -.1250-.12500.3750  plane waves:   5188

maximum and minimum number of plane-waves per node :   5196  5167

maximum number of plane-waves:   5196
maximal index in each direction:
   IXMAX= 11   IYMAX= 11   IZMAX=  9
   IXMIN=-11   IYMIN=-11   IZMIN=-10

WARNING: wrap around error must be expected set NGX to  46
WARNING: wrap around error must be expected set NGY to  46
WARNING: wrap around error must be expected set NGZ to  40

parallel 3dFFT wavefunction:
    minimum data exchange during FFTs selected (reduces bandwidth)
parallel 3dFFT charge:
    minimum data exchange during FFTs selected (reduces bandwidth)
到这里就终止了
我vasp的编译有问题吗?
在另外的机子上这个作业并行是能跑的。
3楼2009-10-20 09:01:46
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liangab_234620

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1,VIP+0):thank you 10-20 19:15
看这个贴!
【分享】Vasp5.2编译碰到p4_error: interrupt SIGSEGV: 11的解决方法
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1542953
4楼2009-10-20 19:13:08
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