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yjcmwgk禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
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【求助】关于自定义cube文件的一个疑问，20金币，谢谢诸位高手
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请教各位大侠： 我想计算静电势（自定义格点文件） 我所知道的方法是： ==gjf文件开始== %chk=G:\sundries\card test\c.chk # B3LYP/6-31+G* cube=(potential,cards) pot 0,1 H 0.0 0.0 0.0 H 0.735396 0.0 0.0 G:\sundries\card test\pot.cube -1 -8.0 -8.0 -8.0 80 0.200 0.000 0.000 80 0.000 0.200 0.000 80 0.000 0.000 0.200 ==gjf文件结束== 我现在想用cubegen命令 如何自定义格点呢？ 高斯03的说明书中关于cubegen的解释我看了，它对自定义格点的指定方法我也看懂了，跟cube一样。但是对格点的说明如何读取呢？我看貌似说是写一个格点说明文件，然后读取这个文件？ 这一点说明书中貌似没给解释啊。也许是我太笨了，呵呵 谢谢诸位大侠 [ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-26 at 13:44 ] |
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lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-27 20:10
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你用的gjf文件自定义cube是没有错的。 小小的缺点是：定义的cube起始点取-8.0，按现在的格点数和步长，要到+8.0，前面格点数是正值80，就是18Å边长。二你算的H2所展开的potential空间的有效分布大约只需边长4～6Å已足够。构建了一个过大的空间，装了一个小图形，实际上降低了作图的精度。 再，既用cube关键词，它直接会生成cube文件，可以省去%行。 如果不用cube关键词而用cubegen命令，手册上如下说，我没有这样做过。 cubegen命令的格式如下， Cubegen memory kind fchkfile cubefile npts format 如果npts取0，按默认格点数等运行。 如果npts取-1，则在下面读入自定义格点文件，格式和你在cube关键词时一样，即： -1 -8.0 -8.0 -8.0 80 0.200 0.000 0.000 80 0.000 0.200 0.000 80 0.000 0.000 0.200 |
3楼2009-10-19 18:02:32
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我自己已经把问题解决了。
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问题已经解决 用cubegen，我习惯于敲一长串字符进去，所有的信息都在一行中，这样不行。 必须用以下方式才行： D:\ProgramFiles\gaussian03w>cubegen Property [Density]? potential Formatted Checkpoint file? G:\sundries\a.fchk Cube file [ ]? test2.cube Approximate points per side [0]? -1 -1 -8.0 -8.0 -8.0 80 0.2 0.2 0.2 80 0.2 0.2 0.2 80 0.2 0.2 0.2 Header in cube file [H]? h [ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-19 at 19:50 ] |
9楼2009-10-19 19:45:08
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