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xiaowwwgao

金虫 (小有名气)

[交流] cif检测几个错误,如何处理,谢谢!

PLAT201_ALERT_2_A Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......         11      
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.03 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         C4     
PLAT242_ALERT_2_A Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for         N4     
晶体cif检测有四个错误,请问各位虫友如何处理?
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
xiaowwwgao(金币+3,VIP+0):谢谢了 10-14 22:29
PLAT201_ALERT_2_A Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......         11      
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.03 Ratio

好几个原子没有各向异性
这一般是不行的, 在.ins中家anis, 再重新修

有C原子的Ueq太大, ,估计是C4, 考虑统计分布处理.

PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         C4     
PLAT242_ALERT_2_A Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for         N4     
晶体cif检测有四个错误,请问各位虫友如何处理?
xi2004-emuch@163.com
2楼2009-10-14 22:20:41
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minhongnju

金虫 (正式写手)


xiaowwwgao(金币+1,VIP+0):谢谢了 10-14 22:40
对于PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.03 Ratio

可以用命令 simu 0.01 0.02 3.8 $c
3楼2009-10-14 22:33:10
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xiaowwwgao

金虫 (小有名气)

再请问一个问题
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    O     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.31 Ratio
如何看cif 文件中是哪些氧不正常?

[ Last edited by xiaowwwgao on 2009-10-14 at 22:50 ]
4楼2009-10-14 22:40:21
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席

引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-10-14 22:20:
PLAT201_ALERT_2_A Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......         11      
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.03 Ratio

好几个原子没有各向异性
这 ...

xi2004不帮忙解决,还问别人?设的考局?
一般,Ueq值的错误用simu、delu限制可以解决。实际上,大部分此类错误都可以解决掉,但是最严谨的方法是重新收数据。
谋事在人,成事在天
5楼2009-10-14 22:47:37
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

既然数据不好,可以考虑低温收集一下。
6楼2009-10-14 23:48:05
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