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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】关于MOF的模拟问题
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topten-gg

银虫 (正式写手)
就是一种显示的问题 把空腔显示为一个大球  或者是圆柱 等等
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11楼2009-10-16 19:33:13
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+2):谢谢 2010-03-14 19:25
步骤1：去剑桥晶体数据库下载你需要的MOF,看图应该是IRMOF系列的，其他的还有COF,PCN,ZIF系列，这个过程需要你提供邮箱，文献名称，作者
步骤2：将得到的CIF文件输入MS,有些时候，CIF文件里面会有一些杂乱分子，需要按照文献结构修改
步骤3：建立还氢气的构型，这个构型需要在另外一个.xsd文件中
步骤4：使用SORPTION模块开始进行GCMC模拟，不过由于氢气在低温下具有量子效应，低温下，需要编程修正，在高温下，就可以开始模拟
步骤5:得到的单个晶胞所含原子个数除以晶胞的原子量就是mmol/g,对于氢气，一般喜欢用wt%，换算过程很简单。
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好好学习，天天向上。
12楼2010-03-14 03:55:57
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huangyc

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
谢谢LZ的无私

能不能说下低温下如何编程修正
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13楼2010-03-14 10:40:35
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by huangyc at 2010-03-14 10:40:35:
谢谢LZ的无私

能不能说下低温下如何编程修正

低温我也没有做过，不过我觉得应该计算出来的值，按照文献里面的公式，去除掉量子效应的影响就好。
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好好学习，天天向上。
14楼2010-03-14 22:27:51
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-14 03:55:57:
步骤1：去剑桥晶体数据库下载你需要的MOF,看图应该是IRMOF系列的，其他的还有COF,PCN,ZIF系列，这个过程需要你提供邮箱，文献名称，作者
步骤2：将得到的CIF文件输入MS,有些时候，CIF文件里面会有一些杂乱分子， ...

忘记说一点，就是骨架的电荷，需要在骨架中切取簇模型，通过量化计算得到，可以选用DMOL3或者GAUSSIAN.在计算结果中，最好选取ESP电荷。
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好好学习，天天向上。
15楼2010-03-15 15:25:18
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