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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】关于MOF的模拟问题

在下刚刚开始做些MOF储氢的计算，遇到以下问题，希望大家给与帮助
1. 用MS做MOF模拟时，MOF空腔中的大球是如何画出来的？
2. 有没有专门的MOF结构的数据库呢？
3. 在小木虫上没有找到关于储氢模拟方面的板块，不知道包含在哪个版块中？
4. 过剩吸附是怎么模拟的呢？

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superman

1楼2009-10-14 16:37:49

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zyj8119

木虫 (著名写手)

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+2):谢谢 2010-03-14 19:25

步骤1：去剑桥晶体数据库下载你需要的MOF,看图应该是IRMOF系列的，其他的还有COF,PCN,ZIF系列，这个过程需要你提供邮箱，文献名称，作者
步骤2：将得到的CIF文件输入MS,有些时候，CIF文件里面会有一些杂乱分子，需要按照文献结构修改
步骤3：建立还氢气的构型，这个构型需要在另外一个.xsd文件中
步骤4：使用SORPTION模块开始进行GCMC模拟，不过由于氢气在低温下具有量子效应，低温下，需要编程修正，在高温下，就可以开始模拟
步骤5:得到的单个晶胞所含原子个数除以晶胞的原子量就是mmol/g,对于氢气，一般喜欢用wt%，换算过程很简单。