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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于MOF的模拟问题

在下刚刚开始做些MOF储氢的计算,遇到以下问题,希望大家给与帮助
1. 用MS做MOF模拟时,MOF空腔中的大球是如何画出来的?
2. 有没有专门的MOF结构的数据库呢?
3. 在小木虫上没有找到关于储氢模拟方面的板块,不知道包含在哪个版块中?
4. 过剩吸附是怎么模拟的呢?
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superman
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zyj8119

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wuli8(金币+2):谢谢 2010-03-14 19:25
步骤1:去剑桥晶体数据库下载你需要的MOF,看图应该是IRMOF系列的,其他的还有COF,PCN,ZIF系列,这个过程需要你提供邮箱,文献名称,作者
步骤2:将得到的CIF文件输入MS,有些时候,CIF文件里面会有一些杂乱分子,需要按照文献结构修改
步骤3:建立还氢气的构型,这个构型需要在另外一个.xsd文件中
步骤4:使用SORPTION模块开始进行GCMC模拟,不过由于氢气在低温下具有量子效应,低温下,需要编程修正,在高温下,就可以开始模拟
步骤5:得到的单个晶胞所含原子个数除以晶胞的原子量就是mmol/g,对于氢气,一般喜欢用wt%,换算过程很简单。
好好学习,天天向上。
12楼2010-03-14 03:55:57
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

大家帮忙了
难道发错版了么  呵呵
superman
2楼2009-10-14 20:48:01
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cel0303

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★
liutao_jlu822(金币+2,VIP+0):谢谢 10-15 20:58
大球?你指的是自由体积吗?很多软件都可以计算出自由体积的,所谓的大球只是一种描述形式
结构可以去剑桥晶体学数据库下载
3楼2009-10-14 23:24:31
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

就是如下图的中间的球是如何计算并显示出来的
其它问题希望大家帮忙解答
superman
4楼2009-10-15 20:59:55
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