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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】关于MOF的模拟问题
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于MOF的模拟问题

在下刚刚开始做些MOF储氢的计算，遇到以下问题，希望大家给与帮助
1. 用MS做MOF模拟时，MOF空腔中的大球是如何画出来的？
2. 有没有专门的MOF结构的数据库呢？
3. 在小木虫上没有找到关于储氢模拟方面的板块，不知道包含在哪个版块中？
4. 过剩吸附是怎么模拟的呢？
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superman
1楼 2009-10-14 16:37:49
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
大家帮忙了
难道发错版了么  呵呵
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superman
2楼2009-10-14 20:48:01
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cel0303

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★
liutao_jlu822(金币+2,VIP+0):谢谢 10-15 20:58
大球？你指的是自由体积吗？很多软件都可以计算出自由体积的，所谓的大球只是一种描述形式
结构可以去剑桥晶体学数据库下载
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3楼2009-10-14 23:24:31
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
就是如下图的中间的球是如何计算并显示出来的
其它问题希望大家帮忙解答
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superman
4楼2009-10-15 20:59:55
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cel0303

铁杆木虫 (小有名气)
★
liutao_jlu822(金币+1,VIP+0):xiexie 10-16 09:46
引用回帖:
Originally posted by liutao_jlu822 at 2009-10-15 20:59:
就是如下图的中间的球是如何计算并显示出来的
其它问题希望大家帮忙解答

计算出来的应该是自由体积，至于如何显示出来应该是制图的问题了吧，和计算没什么关系
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5楼2009-10-15 23:28:50
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stractor

金虫 (著名写手)
★
liutao_jlu822(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-16 13:44
引用回帖:
Originally posted by liutao_jlu822 at 2009-10-15 20:59:
就是如下图的中间的球是如何计算并显示出来的
其它问题希望大家帮忙解答

我原来想做MOFs,就是苦于怎么得到晶体结构而放弃了.MOF里面加富勒烯.

[ Last edited by stractor on 2009-10-21 at 11:29 ]
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6楼2009-10-16 11:53:23
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topten-gg

银虫 (正式写手)
★
liutao_jlu822(金币+1,VIP+0):谢谢 10-16 13:43
那个大球时作图软件的显示    这是yaghi的文章吧
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7楼2009-10-16 12:31:55
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
是yaghi的文章 别人的文章中也是这样的
我想知道是什么软件能够做出这样图 并且怎么做出来的
谢谢大家建议
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superman
8楼2009-10-16 13:43:16
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cel0303

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢交流 10-16 18:38
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2009-10-16 11:53:

这好象是PRL文章的图,我原来想做MOFs,就是苦于怎么得到晶体结构而放弃了.MOF里面加富勒烯.

[ Last edited by stractor on 2009-10-16 at 11:56 ]

结构可以在剑桥晶体学数据库下，富勒烯在MS建模里面好像有这个功能
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9楼2009-10-16 15:19:01
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topten-gg

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
liutao_jlu822(金币+2,VIP+0):谢谢 我找找diamond 10-16 21:25
引用回帖:
Originally posted by liutao_jlu822 at 2009-10-16 13:43:
是yaghi的文章 别人的文章中也是这样的
我想知道是什么软件能够做出这样图 并且怎么做出来的
谢谢大家建议

做MOF的都用的软件---diamond

很容易做出空腔的这种结构的
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10楼2009-10-16 19:32:28
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