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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】关于MOF的模拟问题
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于MOF的模拟问题

在下刚刚开始做些MOF储氢的计算，遇到以下问题，希望大家给与帮助
1. 用MS做MOF模拟时，MOF空腔中的大球是如何画出来的？
2. 有没有专门的MOF结构的数据库呢？
3. 在小木虫上没有找到关于储氢模拟方面的板块，不知道包含在哪个版块中？
4. 过剩吸附是怎么模拟的呢？
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superman
1楼 2009-10-14 16:37:49
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-14 03:55:57:
步骤1：去剑桥晶体数据库下载你需要的MOF,看图应该是IRMOF系列的，其他的还有COF,PCN,ZIF系列，这个过程需要你提供邮箱，文献名称，作者
步骤2：将得到的CIF文件输入MS,有些时候，CIF文件里面会有一些杂乱分子， ...

忘记说一点，就是骨架的电荷，需要在骨架中切取簇模型，通过量化计算得到，可以选用DMOL3或者GAUSSIAN.在计算结果中，最好选取ESP电荷。
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好好学习，天天向上。
15楼2010-03-15 15:25:18
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
大家帮忙了
难道发错版了么  呵呵
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superman
2楼2009-10-14 20:48:01
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cel0303

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★
liutao_jlu822(金币+2,VIP+0):谢谢 10-15 20:58
大球？你指的是自由体积吗？很多软件都可以计算出自由体积的，所谓的大球只是一种描述形式
结构可以去剑桥晶体学数据库下载
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2009-10-14 23:24:31
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
就是如下图的中间的球是如何计算并显示出来的
其它问题希望大家帮忙解答
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superman
4楼2009-10-15 20:59:55
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