| 查看: 1149 | 回复: 2 | |||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者大力2010将赠送您 10 个金币 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
请教高手，微扰密度泛函方法(DFPT)计算声子谱，phonopy得不到band.yaml文件，咋办已有1人参与
|
|||
|
VASP结合Phonopy计算声子谱，微扰密度泛函方法(DFPT)，计算结束后运行phonopy --fc vasprun.xml得到FORCE_CONSTANTS文件，准备band.conf文件， 运行phonopy --dim 2 2 2 -c POSCAR-unitcell band.conf得不到band.yaml文件。出现提示： "band.conf" was read as phonopy configuration file. Crystal structure was read from "POSCAR-unitcell". Unit of length: angstrom Band structure mode Settings: Force constants symmetrization: on Supercell: [2 2 2] Spacegroup: Pbcm (57) Use -v option to watch primitive cell, unit cell, and supercell structures. Force constants are read from "FORCE_CONSTANTS". Number of atoms in supercell (224) is not consistent with the matrix shape of force constants (28, 28) read from FORCE_CONSTANTS. Please carefully check DIM, FORCE_CONSTANTS, and POSCAR-unitcell. |
回复此楼» 猜你喜欢
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有5人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有7人回复
-
申请2026年博士
已经有5人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有5人回复
-
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有6人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有7人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有6人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有7人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
|
我是参照找个教程 （ force constant 文件是在计算结束后运行phonopy --fc vasprun.xml得到的 ）： 微扰密度泛函方法(DFPT) 将SPOSCAR复制为POSCAR，INCAR设置如下 Global Parameters ISTART = 0 ISPIN = 1 ICHARG = 2 LREAL = .FALSE. ENCUT = 500 PREC = A LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. ADDGRID= .TRUE. Electronic Relaxation ISMEAR = 0 SIGMA = 0.05 NELM = 90 NELMIN = 6 EDIFF = 1E-08 GGA = PE ALGO = N Ionic Relaxation NSW = 1 IBRION = 8 EDIFFG = -0.01 KPOINTS为 K-Spacing Value to Generate K-Mesh: 0.040 0 Gamma 4 4 4 0.0 0.0 0.0 计算结束后运行phonopy --fc vasprun.xml得到FORCE_CONSTANTS文件。 准备band.conf文件，如下 ATOM_NAME = Si DIM = 2 2 2 BAND = 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.0, 0.5 0.5 1.0 0.0 0.0 0.0, 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.5 BAND_POINTS = 51 BAND_LABELS = $\Gamma$ X, X $\Gamma$, $\Gamma$ L BAND_CONNECTION = .TRUE. FORCE_CONSTANTS = READ FC_SYMMETRY = .TRUE. 运行phonopy --dim 2 2 2 -c POSCAR-unitcell band.conf得到band.yaml文件。 运行phonopy-bandplot --gnuplot > band.dat得到可用Origin画图的band.dat文件。 注意：如果想要直接出图，可以运行phonopy -c POSCAR-unitcell band.conf -p -s，之后会得到band.pdf文件等，里边绘制好了声子谱。 |
3楼2024-02-21 10:37:25
dxcharlary
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +83 - 1ST强帖: 2
- 应助: 251 (大学生)
- 金币: 10398.6
- 散金: 155
- 红花: 65
- 帖子: 3137
- 在线: 757.1小时
- 虫号: 936718
- 注册: 2010-01-04
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 第一性原理
2楼2024-02-11 20:55:39