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请教高手，微扰密度泛函方法(DFPT)计算声子谱，phonopy得不到band.yaml文件，咋办 已有1人参与
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VASP结合Phonopy计算声子谱，微扰密度泛函方法(DFPT)，计算结束后运行phonopy --fc vasprun.xml得到FORCE_CONSTANTS文件，准备band.conf文件， 运行phonopy --dim 2 2 2 -c POSCAR-unitcell band.conf得不到band.yaml文件。出现提示： "band.conf" was read as phonopy configuration file. Crystal structure was read from "POSCAR-unitcell". Unit of length: angstrom Band structure mode Settings: Force constants symmetrization: on Supercell: [2 2 2] Spacegroup: Pbcm (57) Use -v option to watch primitive cell, unit cell, and supercell structures. Force constants are read from "FORCE_CONSTANTS". Number of atoms in supercell (224) is not consistent with the matrix shape of force constants (28, 28) read from FORCE_CONSTANTS. Please carefully check DIM, FORCE_CONSTANTS, and POSCAR-unitcell. |
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dxcharlary
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2楼2024-02-11 20:55:39
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我是参照找个教程 （ force constant 文件是在计算结束后运行phonopy --fc vasprun.xml得到的 ）： 微扰密度泛函方法(DFPT) 将SPOSCAR复制为POSCAR，INCAR设置如下 Global Parameters ISTART = 0 ISPIN = 1 ICHARG = 2 LREAL = .FALSE. ENCUT = 500 PREC = A LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. ADDGRID= .TRUE. Electronic Relaxation ISMEAR = 0 SIGMA = 0.05 NELM = 90 NELMIN = 6 EDIFF = 1E-08 GGA = PE ALGO = N Ionic Relaxation NSW = 1 IBRION = 8 EDIFFG = -0.01 KPOINTS为 K-Spacing Value to Generate K-Mesh: 0.040 0 Gamma 4 4 4 0.0 0.0 0.0 计算结束后运行phonopy --fc vasprun.xml得到FORCE_CONSTANTS文件。 准备band.conf文件，如下 ATOM_NAME = Si DIM = 2 2 2 BAND = 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.0, 0.5 0.5 1.0 0.0 0.0 0.0, 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.5 BAND_POINTS = 51 BAND_LABELS = $\Gamma$ X, X $\Gamma$, $\Gamma$ L BAND_CONNECTION = .TRUE. FORCE_CONSTANTS = READ FC_SYMMETRY = .TRUE. 运行phonopy --dim 2 2 2 -c POSCAR-unitcell band.conf得到band.yaml文件。 运行phonopy-bandplot --gnuplot > band.dat得到可用Origin画图的band.dat文件。 注意：如果想要直接出图，可以运行phonopy -c POSCAR-unitcell band.conf -p -s，之后会得到band.pdf文件等，里边绘制好了声子谱。 |
3楼2024-02-21 10:37:25