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bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】如何批量把chemdrw类型的分子转化成smiles格式呢?

1.如题?
2.smiles格式分子如何检查对错?  通过看分子式怎么写smiles格式?多谢了

[ Last edited by zeoliters on 2009-11-13 at 18:19 ]
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

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mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流! 10-14 00:33
(1) openbabel
(2) chemdraw可以copy as smiles、paste smiles...
2楼2009-10-13 22:25:36
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bbslover

金虫 (正式写手)

嗯,这个chemdraw 我会使用了,openbabel没有试验呢。呵呵。
3楼2009-10-13 23:46:56
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

引用回帖:
Originally posted by bbslover at 2009-10-13 23:46:
嗯,这个chemdraw 我会使用了,openbabel没有试验呢。呵呵。

ChemDraw是少年长拳
OpenBabel是少林易筋经
4楼2009-10-14 00:31:29
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bbslover

金虫 (正式写手)

哈哈,openbabel看来很是强大啊?
5楼2009-10-14 01:03:16
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bbslover

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009-10-14 00:31:


ChemDraw是少年长拳
OpenBabel是少林易筋经

还有个问题,我有smiles格式了,如何才能转化为2D或者3D呢?
6楼2009-10-14 01:04:06
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
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mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流! 10-14 17:36
当然是openbabel 2.2.1咯。
7楼2009-10-14 01:38:26
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bbslover

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009-10-14 01:38:
当然是openbabel 2.2.1咯。

好,2.2.3肯定也行咯。 不行了,我得睡觉了。多谢老汉。
8楼2009-10-14 02:02:06
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