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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】适用于模拟溶液系统的软件
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lifei2008

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】适用于模拟溶液系统的软件

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[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:30 ]
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生命不息，奋斗不止！
1楼 2009-10-13 16:41:10
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼主想得到什么信息呢？
模拟溶液的性质?
一般的MD的方法似乎都可以的。。。。
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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
2楼2009-10-13 18:00:53
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lifei2008

木虫 (小有名气)
就是要计算离子水化数，径向分布函数等一些与溶液结构有关的信息。
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生命不息，奋斗不止！
3楼2009-10-14 09:19:52
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lifei2008

木虫 (小有名气)
我师兄以前用的模拟软件是MS，可是据说这个软件不太好，是黑箱操作，有许多信息是看不到的。
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生命不息，奋斗不止！
4楼2009-10-14 09:23:25
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-14 10:37
如果溶质是有机小分子,离子或蛋白等大分子的话,namd 和gmx 非常合适
如果是有机大分子,MS可能更好些
如果是金属/无机晶粒,可能要一些变通
如果胶体,量子点之类,就得用DPD了
赞一下(11人) 回复此楼
5楼2009-10-14 10:09:34
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lifei2008

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2009-10-14 10:09:
如果溶质是有机小分子,离子或蛋白等大分子的话,namd 和gmx 非常合适
如果是有机大分子,MS可能更好些
如果是金属/无机晶粒,可能要一些变通
如果胶体,量子点之类,就得用DPD了

多谢指点！
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生命不息，奋斗不止！
6楼2009-10-15 14:13:37
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