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小罗米

铁虫 (初入文坛)

[交流] PCR定点突变

本人刚开始做定点突变,有问题想请教一下。我的片段大概800bp,克隆在22b质粒上。现在想在片段上改变一个或者几个碱基。不打算用试剂盒。网上搜了几种方法,比较快的是用高保真酶来做PCR,得到整个质粒后用Dnp I 酶进行消化然后转化至大肠杆菌。
那么我想问,用高保真酶设计引物的时候,是以突变碱基为中心点,两边延伸12-16个碱基(即突变碱基在引物中心),还是以引物5‘端邻接,3’端相反的原则进行设计呢?还有的说突变点位于5‘端第5位,我都要晕了。帮帮忙吧。
另外退火时间一般设多长?说明书上是5s或15s,有人用30s。
这种方法还有什么值得注意的地方么?多谢大家了。

[ Last edited by zzgyb on 2009-12-21 at 20:29 ]

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gyesang

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小罗米(金币+1,VIP+0): 10-22 16:13
做overlapingPCR也不错啊
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2009-10-20 22:32:27
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yuanqing6622

新虫 (初入文坛)

呵呵,不是一个专业的,不太懂
3楼2009-10-30 12:04:42
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yscheng

新虫 (小有名气)

想做,还没做,也不太清楚撒
4楼2009-10-31 12:59:47
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fjc100648

金虫 (小有名气)


小罗米(金币+1,VIP+0): 11-6 17:00
做过一个,按全式金公司的说明书做得,没用他的试剂盒。他的引物设计很有特色,是指数扩增,而国外公司的都是线性扩增。你可以按他们的引物设计来试试。
5楼2009-11-01 15:22:36
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小罗米

铁虫 (初入文坛)

没有人给出正确的答案~本求助结束。
6楼2009-11-06 17:11:10
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