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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Wien2k&FLAPW&ELK » 【求助】Wien2k怎么建非晶的初始结构模型？
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3245186

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Wien2k怎么建非晶的初始结构模型？

Wien2k怎么建非晶的初始结构？supercell怎么建？我是新手，刚接触，以前也没做过计算，在structure页面设置里面怎么也找不到相应的选项。看UG里面讲是：

mkdir super
cd suoer
cp ../TiC/TiC.struct
x supercell

我在软件界面里面也找不到输入命令的地方。
我的软件是虚拟机里面装的（直接从别人那拷过来，我不会装），可以直接在windows界面进行操作。UG里面的TiC例子跑完了一次。

还请高手指点。先谢谢了。

[ Last edited by 3245186 on 2009-10-12 at 17:09 ]
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1楼 2009-10-12 10:25:11
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3245186

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by gzqdyouxia at 2009-10-20 15:12:

直接在super.struct中删掉一行就好啦
16.357476 16.357476 16.357476 90.000000 90.000000 90.000000
ATOM   1: X=0.00000000 Y=0.00000000 Z=0.00000000
          MULT= 8          ISPLIT= 2
       1: ...

GeTe                                                                           
P   LATTICE,NONEQUIV. ATOMS 64     
MODE OF CALC=RELA unit=ang
22.676722 22.676722 22.676722 90.000000 90.000000 90.000000
ATOM   1: X=0.00000000 Y=0.00000000 Z=0.00000000
          MULT= 32          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
ATOM   2: X=0.50000000 Y=0.00000000 Z=0.00000000
          MULT= 1          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
ATOM   3: X=0.00000000 Y=0.50000000 Z=0.00000000
          MULT= 1          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
ATOM   4: X=0.50000000 Y=0.50000000 Z=0.00000000
          MULT= 1          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
ATOM   5: X=0.00000000 Y=0.00000000 Z=0.50000000
          MULT= 1          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
ATOM   6: X=0.50000000 Y=0.00000000 Z=0.50000000
          MULT= 1          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
ATOM   7: X=0.00000000 Y=0.50000000 Z=0.50000000
          MULT= 1          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
ATOM   8: X=0.50000000 Y=0.50000000 Z=0.50000000
          MULT= 1          ISPLIT= 2
Te         NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    2.1000   Z: 52.0
LOCAL ROT MATRIX:    1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000

........

我的格式是这样的,怎么才能变成你那样?所有坐标都在一块.很直观.
赞一下 回复此楼
15楼2009-10-22 20:28:21
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gzqdyouxia

金虫 (著名写手)

羞答答的老大
我也是新手，还没用过super，嘿嘿，我在我的机子上试试阿
赞一下 回复此楼
一不小心耽误了几年
2楼2009-10-13 07:34:29
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gzqdyouxia

金虫 (著名写手)

羞答答的老大
★ ★
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q! 鼓励讨论！ 10-13 14:14
3245186(金币+1,VIP+0):谢谢 10-13 20:27
直接x super
然后输入原来的结构文件如：TiC.struct
然后设置x y z就好啦，直接生成TiC_super.struct
不知道我理解的对不对阿，这样就生成结构模型了！
赞一下(11人) 回复此楼
一不小心耽误了几年
3楼2009-10-13 07:46:36
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
3245186(金币+3,VIP+0):非常感谢 10-13 19:21
qasd(金币+2,VIP+0):谢谢 10-13 19:58
引用回帖:
Originally posted by 3245186 at 2009-10-12 10:25:
Wien2k怎么建非晶的初始结构？supercell怎么建？我是新手，刚接触，以前也没做过计算，在structure页面设置里面怎么也找不到相应的选项。看UG里面讲是：

mkdir super
cd suoer
cp ../TiC/TiC.struct
x supe ...

xsupercell没有对应的才做界面，需要在终端输入命令，
黑屏上会提示处理的文件名，
接着就是超晶胞的扩展方向，
再接着是建立表面的操作，
……

问一句，
超晶胞建立好了之后，也只是超晶胞，你怎么说是”非晶“呢，它还是晶体啊，
另外，wien2k能算非晶吗？不能吧
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储氢家族欢迎储氢研究者！
4楼2009-10-13 14:18:19
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