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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Wien2k&FLAPW&ELK » 【求助】Wien2k怎么建非晶的初始结构模型？
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【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 3245186 的 1 个金币

3245186

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Wien2k怎么建非晶的初始结构模型？

Wien2k怎么建非晶的初始结构？supercell怎么建？我是新手，刚接触，以前也没做过计算，在structure页面设置里面怎么也找不到相应的选项。看UG里面讲是：

mkdir super
cd suoer
cp ../TiC/TiC.struct
x supercell

我在软件界面里面也找不到输入命令的地方。
我的软件是虚拟机里面装的（直接从别人那拷过来，我不会装），可以直接在windows界面进行操作。UG里面的TiC例子跑完了一次。

还请高手指点。先谢谢了。

[ Last edited by 3245186 on 2009-10-12 at 17:09 ]
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1楼 2009-10-12 10:25:11
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gzqdyouxia

金虫 (著名写手)

羞答答的老大
我也是新手，还没用过super，嘿嘿，我在我的机子上试试阿
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一不小心耽误了几年
2楼2009-10-13 07:34:29
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gzqdyouxia

金虫 (著名写手)

羞答答的老大
★ ★
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q! 鼓励讨论！ 10-13 14:14
3245186(金币+1,VIP+0):谢谢 10-13 20:27
直接x super
然后输入原来的结构文件如：TiC.struct
然后设置x y z就好啦，直接生成TiC_super.struct
不知道我理解的对不对阿，这样就生成结构模型了！
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一不小心耽误了几年
3楼2009-10-13 07:46:36
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
3245186(金币+3,VIP+0):非常感谢 10-13 19:21
qasd(金币+2,VIP+0):谢谢 10-13 19:58
引用回帖:
Originally posted by 3245186 at 2009-10-12 10:25:
Wien2k怎么建非晶的初始结构？supercell怎么建？我是新手，刚接触，以前也没做过计算，在structure页面设置里面怎么也找不到相应的选项。看UG里面讲是：

mkdir super
cd suoer
cp ../TiC/TiC.struct
x supe ...

xsupercell没有对应的才做界面，需要在终端输入命令，
黑屏上会提示处理的文件名，
接着就是超晶胞的扩展方向，
再接着是建立表面的操作，
……

问一句，
超晶胞建立好了之后，也只是超晶胞，你怎么说是”非晶“呢，它还是晶体啊，
另外，wien2k能算非晶吗？不能吧
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储氢家族欢迎储氢研究者！
4楼2009-10-13 14:18:19
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anin

木虫 (著名写手)

如来的神掌
第一性原理可以计算非晶体吗？楼主在开玩笑吧~~~~~
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问君能有几多愁，恰似一群太监上青楼~
5楼2009-10-13 17:45:38
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3245186

木虫 (正式写手)
问一句，
超晶胞建立好了之后，也只是超晶胞，你怎么 ... [/quote]

我是想从一个超晶胞里进行改动,拿掉一些原子达到产生空位的目的.然后想,要是随着混乱度的增加,是不是可能变成非晶.其实我也不知道可不可以,由于没用过,见笑了.
建好超晶胞后,还是没有菜单界面操作,怎么删除指定的原子?

[ Last edited by 3245186 on 2009-10-13 at 20:38 ]
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6楼2009-10-13 20:27:28
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3245186

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by anin at 2009-10-13 17:45:
第一性原理可以计算非晶体吗？楼主在开玩笑吧~~~~~

第一性原理为什么不能算非晶,是不是由于其原子数目大的原因?我不明白.我也是想从supercell进行修改,看能不能改成非晶(自己想的,没有根据).
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7楼2009-10-13 20:30:28
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shiy

木虫 (小有名气)
★ ★
3245186(金币+1,VIP+0):3Q 10-14 18:32
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论！ 10-20 20:30
想法比较好，但是第一性原理计算主要是用来计算晶体，就算是超胞，也只是晶体中的空位、掺杂还有计算表面性质，计算非晶的话，这么小的尺度与非晶的实际情况不太符合，最主要的是wein2k不含分子动力学因素，这是个人觉得不能做非晶的最主要原因。
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8楼2009-10-14 10:27:43
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gzqdyouxia

金虫 (著名写手)

羞答答的老大
★ ★
3245186(金币+1,VIP+0):谢谢 10-14 18:32
aylayl08(金币+1,VIP+0):个人认为也可以算非晶，呵呵，欢迎讨论 10-23 14:34
我导师说，即便是算非晶也是根据晶体的算，取一个很大的超晶，周围作用很小就可以啦！可以这样算，就是会很慢的。
赞一下(7人) 回复此楼
一不小心耽误了几年
9楼2009-10-14 10:31:24
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3245186

木虫 (正式写手)
★
aylayl08(金币+1,VIP+0):欢迎讨论 10-23 14:34
引用回帖:
Originally posted by gzqdyouxia at 2009-10-14 10:31:
我导师说，即便是算非晶也是根据晶体的算，取一个很大的超晶，周围作用很小就可以啦！可以这样算，就是会很慢的。

确实是这样,现在没有非晶的结构,一般都是让晶体升温再急冷.我的想法也是这样,从一个超晶胞里面去加条件,不过,这些条件都有人为的因素在里面.

周围作用很小怎么弄?
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10楼2009-10-14 18:30:51
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