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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 超长引物PCR
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hobers

铁虫 (初入文坛)

[交流] 超长引物PCR

老板在国外带回一个新质粒要我们做，首先要做一个超长引物的PCR过程，因为引物里要加上信号肽和his标签等，上游引物长达97个碱基，下游引物也有51个碱基，请问：

1.这样的引物要如何分析确定是否可以用于PCR？
2.PCR程序又要怎么设置？？

望高手赐教！！不胜感激！

上游引物：5-GCTGGATCCATGAAATTCTTAGTCAACGTTGCCCTTGTTTTTATGGTCGTGTACATTTCTTACATCTATGCGCAACTGTGGAGATGTCAGAGGCAGT-3
下游引物：5-CGTAAGCTTTTAGTGATGGTGATGGTGATGGGGCCATGCTCTGAATGGGCA-3
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1楼 2009-10-11 22:15:15
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lixiahe

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这么长的引物基本不用去考虑它的二级结构了，把退火和延伸合并起来试试看。
SOE(重叠序列延伸法)也可以试试

[ Last edited by lixiahe on 2009-10-12 at 13:48 ]
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天天小木虫
13楼2009-10-12 13:46:45
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个引物也太长了吧！光合成出来就不便宜啊~为什么不分几次进行PCR扩增呢？
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2楼2009-10-11 22:24:13
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keilion

铜虫 (小有名气)
引物的确很长，难度较大。希望有高人指点吧！
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3楼2009-10-11 23:12:12
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+3,VIP+0): 10-12 08:17
引用回帖:
Originally posted by hobers at 2009-10-11 22:15:
老板在国外带回一个新质粒要我们做，首先要做一个超长引物的PCR过程，因为引物里要加上信号肽和his标签等，上游引物长达97个碱基，下游引物也有51个碱基，请问：

1.这样的引物要如何分析确定是否可以用于PCR？ ...

质粒已经有了，引物是用来扩什么的？你要在质粒的基础上自己重新构建一个质粒吗？
说说你质粒的大小，用途，还有你为什么要设计这对引物，越详细越好
大家好帮助比啊
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小木虫之有关部门负责人
4楼2009-10-11 23:17:38
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