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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】sybyl中的leapfrog如何使用？
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童心

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】sybyl中的leapfrog如何使用？

看别人文献中讲一个分子优化后，与一个库的所有分子用leapfrog进行筛选，进行30000interations，我不知道这个30000步是哪里设置的？
另外问个另外问题，文献中是把目标分子和库里面的分子都用MIni2优化后，我把单一分子优化后直接保存在库里，应该就是优化后的分子建立的库吧？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 20:58 ]
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1楼 2009-10-10 16:08:24
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qinqin837

铜虫 (小有名气)
★ ★
童心(金币+1,VIP+0):谢谢！ 10-15 09:29
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-15 16:34
30000是move操作次数，在leapfrog的主界面就可以设置。优化后会另外生成一个新分子库默认好像为LFOUT01.mdb
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我的ID叫qinqin837，但我不是83年7月生的哦，我没那么大……
2楼2009-10-14 22:15:07
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童心

木虫 (正式写手)
我目前在leapfrog的下级参数菜单里面有个地方找到了interation的一个参数，目前把它设置为30000，已经运算了快3天还未停，因为这时候在运算不能打开参数设置界面，我感觉是不是我用的optimize模式而不是guide模式，所以导致算这么久，不知道这两个有啥不同？
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3楼2009-10-15 09:32:43
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