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wujiangjie木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】请教大虾关于DNA分子模拟的一些问题
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各位大虾，最近我需要建立DNA双螺旋结构，可是pdb数据库中没有我所用的序列，请问在Gromacs中要建立这个模型时，该怎么建立，可以直接将一个从pdb数据库中搜索到的模型进行修改，变为我所需要的序列后直接导入Gromacs中吗？还有那个力场用Amber99可以吗？另外我查阅了一些文献，有用Gromacs，也有用Namd的，请问这两个在做DNA模拟方面有什么区别吗？谢谢 [ Last edited by zdhlover on 2009-11-13 at 13:41 ] |
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zhuhongaaa
金虫 (正式写手)
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- 专业: 高分子物理与高分子物理化
2楼2009-10-10 22:17:15