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bigenid

木虫 (著名写手)


[交流] 求解:评审专家提出KEGG显著富集通路上的6个基因,但在GO富集中不显著?咋解释?

求解:评审专家提出KEGG显著富集通路上的基因,在GO富集中不显著?咋解释?
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bigenid

木虫 (著名写手)


引用回帖:
10楼: Originally posted by lisaru at 2023-09-26 10:50:21
这审稿专家也是一知半解,KEGG和GO是不同的富集方式,结果当然可能不同。富集显著性与所在通路基因数目有关,KEGG和GO本来就是不同的分类方式,怎么好拿来横向比较?

学习了。
非常感谢您的解答!!
11楼2023-09-26 22:00:15
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micro_lsp

捐助贵宾 (职业作家)



bigenid(金币+1): 谢谢参与
两种富集就不是一回事,有差异也是正常的。

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6楼2023-09-23 10:38:41
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走了002

新虫 (著名写手)



bigenid(金币+1): 谢谢参与
主要看kegg通路,go没啥意义,常规分析即可

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2023-09-23 12:46:27
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bigenid

木虫 (著名写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by micro_lsp at 2023-09-23 10:38:41
两种富集就不是一回事,有差异也是正常的。

KEGG和GO哪个更重要一些呢?
8楼2023-09-23 17:13:54
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zusn3楼
2023-09-23 09:25   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
2楼: Originally posted by bigenid at 2023-09-23 09:20:36

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2023-09-23 09:44   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
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2023-09-23 10:21   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
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