应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 学术交流区 » 论文投稿 » 交流 » 求解：评审专家提出KEGG显著富集通路上的6个基因，但在GO富集中不显著？咋解释？
161/1返回列表
查看: 2051  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

bigenid

木虫 (著名写手)

[交流] 求解：评审专家提出KEGG显著富集通路上的6个基因，但在GO富集中不显著？咋解释？

求解：评审专家提出KEGG显著富集通路上的基因，在GO富集中不显著？咋解释？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2023-09-23 09:10:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

bigenid

木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lisaru at 2023-09-26 10:50:21
这审稿专家也是一知半解，KEGG和GO是不同的富集方式，结果当然可能不同。富集显著性与所在通路基因数目有关，KEGG和GO本来就是不同的分类方式，怎么好拿来横向比较？

学习了。
非常感谢您的解答！！
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2023-09-26 22:00:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

micro_lsp

捐助贵宾 (职业作家)
★
bigenid(金币+1): 谢谢参与
两种富集就不是一回事，有差异也是正常的。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2023-09-23 10:38:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

走了002

新虫 (著名写手)
★
bigenid(金币+1): 谢谢参与
主要看kegg通路，go没啥意义，常规分析即可

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

bigenid bigenid
7楼2023-09-23 12:46:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by micro_lsp at 2023-09-23 10:38:41
两种富集就不是一回事，有差异也是正常的。

KEGG和GO哪个更重要一些呢？
赞一下 回复此楼
8楼2023-09-23 17:13:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 走了002 at 2023-09-23 12:46:27
主要看kegg通路，go没啥意义，常规分析即可

非常感谢您的解答！！
赞一下 回复此楼
9楼2023-09-23 17:15:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisaru

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这审稿专家也是一知半解，KEGG和GO是不同的富集方式，结果当然可能不同。富集显著性与所在通路基因数目有关，KEGG和GO本来就是不同的分类方式，怎么好拿来横向比较？
赞一下 回复此楼
10楼2023-09-26 10:50:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lisaru at 2023-09-26 10:50:21
这审稿专家也是一知半解，KEGG和GO是不同的富集方式，结果当然可能不同。富集显著性与所在通路基因数目有关，KEGG和GO本来就是不同的分类方式，怎么好拿来横向比较？

那在分析的时候，重点强调KEGG通路，还是强调GO功能呢？哪个重要？？
赞一下 回复此楼
12楼2023-09-26 22:02:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 走了002 at 2023-09-23 12:46:27
主要看kegg通路，go没啥意义，常规分析即可

这么说，挖掘重点差异基因，主要从kegg通路上寻找吗？
赞一下 回复此楼
13楼2023-09-26 22:05:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wddong

铜虫 (小有名气)
加油

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
14楼2023-09-26 22:13:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisaru

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by bigenid at 2023-09-26 22:02:07
那在分析的时候，重点强调KEGG通路，还是强调GO功能呢？哪个重要？？...

其实都可以，根据你的研究需要，哪个能给你更明确的方向就用哪个，没有人规定必需用哪一个。一般情况，KEGG分类更细，所以信息更明确一些，我用的比较多；GO分类都是大类，所以比较宏观一些。不过两种富集分析的维度差别很大，不好横向比较，根据你的研究需求选择即可，没有统一标准。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

bigenid
15楼2023-09-26 22:51:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
15楼: Originally posted by lisaru at 2023-09-26 22:51:04
其实都可以，根据你的研究需要，哪个能给你更明确的方向就用哪个，没有人规定必需用哪一个。一般情况，KEGG分类更细，所以信息更明确一些，我用的比较多；GO分类都是大类，所以比较宏观一些。不过两种富集分析的维 ...

万分感谢！！ 我参考着分析一下
赞一下 回复此楼
16楼2023-09-27 15:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
bigenid2楼
2023-09-23 09:20   回复  
zusn3楼
2023-09-23 09:25   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
2楼: Originally posted by bigenid at 2023-09-23 09:20:36

发自小木虫Android客户端
没有感觉的鱼4楼
2023-09-23 09:44   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫IOS客户端
水可南阳5楼
2023-09-23 10:21   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
相关版块跳转 我要订阅楼主 bigenid 的主题更新
161/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗？ 200+5 David1982 2026-10-13 9/450 2026-10-15 08:34 by dypengfei
[硕博家园] 极限拉扯，如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[硕博家园] 中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理 +3 sujiner 2026-10-08 4/200 2026-10-14 20:40 by qicaiyun
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +4 好运来～9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭