应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 学术交流区 » 论文投稿 » 交流 » 求解：评审专家提出KEGG显著富集通路上的6个基因，但在GO富集中不显著？咋解释？
161/1返回列表
查看: 1876  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

bigenid

木虫 (著名写手)

[交流] 求解：评审专家提出KEGG显著富集通路上的6个基因，但在GO富集中不显著？咋解释？

求解：评审专家提出KEGG显著富集通路上的基因，在GO富集中不显著？咋解释？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2023-09-23 09:10:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

bigenid

木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lisaru at 2023-09-26 10:50:21
这审稿专家也是一知半解，KEGG和GO是不同的富集方式，结果当然可能不同。富集显著性与所在通路基因数目有关，KEGG和GO本来就是不同的分类方式，怎么好拿来横向比较？

学习了。
非常感谢您的解答！！
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2023-09-26 22:00:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

micro_lsp

捐助贵宾 (职业作家)
★
bigenid(金币+1): 谢谢参与
两种富集就不是一回事，有差异也是正常的。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2023-09-23 10:38:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

走了002

新虫 (著名写手)
★
bigenid(金币+1): 谢谢参与
主要看kegg通路，go没啥意义，常规分析即可

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

bigenid bigenid
7楼2023-09-23 12:46:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by micro_lsp at 2023-09-23 10:38:41
两种富集就不是一回事，有差异也是正常的。

KEGG和GO哪个更重要一些呢？
赞一下 回复此楼
8楼2023-09-23 17:13:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 走了002 at 2023-09-23 12:46:27
主要看kegg通路，go没啥意义，常规分析即可

非常感谢您的解答！！
赞一下 回复此楼
9楼2023-09-23 17:15:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisaru

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这审稿专家也是一知半解，KEGG和GO是不同的富集方式，结果当然可能不同。富集显著性与所在通路基因数目有关，KEGG和GO本来就是不同的分类方式，怎么好拿来横向比较？
赞一下 回复此楼
10楼2023-09-26 10:50:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lisaru at 2023-09-26 10:50:21
这审稿专家也是一知半解，KEGG和GO是不同的富集方式，结果当然可能不同。富集显著性与所在通路基因数目有关，KEGG和GO本来就是不同的分类方式，怎么好拿来横向比较？

那在分析的时候，重点强调KEGG通路，还是强调GO功能呢？哪个重要？？
赞一下 回复此楼
12楼2023-09-26 22:02:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 走了002 at 2023-09-23 12:46:27
主要看kegg通路，go没啥意义，常规分析即可

这么说，挖掘重点差异基因，主要从kegg通路上寻找吗？
赞一下 回复此楼
13楼2023-09-26 22:05:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wddong

铜虫 (小有名气)
加油

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
14楼2023-09-26 22:13:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisaru

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by bigenid at 2023-09-26 22:02:07
那在分析的时候，重点强调KEGG通路，还是强调GO功能呢？哪个重要？？...

其实都可以，根据你的研究需要，哪个能给你更明确的方向就用哪个，没有人规定必需用哪一个。一般情况，KEGG分类更细，所以信息更明确一些，我用的比较多；GO分类都是大类，所以比较宏观一些。不过两种富集分析的维度差别很大，不好横向比较，根据你的研究需求选择即可，没有统一标准。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

bigenid
15楼2023-09-26 22:51:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigenid

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
15楼: Originally posted by lisaru at 2023-09-26 22:51:04
其实都可以，根据你的研究需要，哪个能给你更明确的方向就用哪个，没有人规定必需用哪一个。一般情况，KEGG分类更细，所以信息更明确一些，我用的比较多；GO分类都是大类，所以比较宏观一些。不过两种富集分析的维 ...

万分感谢！！ 我参考着分析一下
赞一下 回复此楼
16楼2023-09-27 15:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
bigenid2楼
2023-09-23 09:20   回复  
zusn3楼
2023-09-23 09:25   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
2楼: Originally posted by bigenid at 2023-09-23 09:20:36

发自小木虫Android客户端
没有感觉的鱼4楼
2023-09-23 09:44   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫IOS客户端
水可南阳5楼
2023-09-23 10:21   回复  
bigenid(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
相关版块跳转 我要订阅楼主 bigenid 的主题更新
161/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 什么时候开奖？ +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +5 炎黄贵胄 2026-08-22 6/300 2026-08-24 06:34 by sincosx
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +16 羊腰板 2026-08-21 17/850 2026-08-23 23:02 by tianxiaochun
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭