| 查看: 252 | 回复: 2 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
有关NCBI提交序列的问题！急！！
|
|||
|
我向NCBI提交序列，但反馈说需要提供organism source 和具体信息。请问这里的organism source是要说明它是哪个属和种的吗？可我做的是酵母菌鉴定，并不能确定它是具体的那个种的呀？ 换句话说是不是向NCBI提交序列需要知道这个菌株是那个种的。 |
回复此楼
09021122
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2064.5
- 红花: 1
- 沙发: 1
- 帖子: 518
- 在线: 113.5小时
- 虫号: 856621
- 注册: 2009-09-25
- 性别: GG
- 专业: 系统生物学
|
向NCBI提交序列常用的程序有两个，一个是在线提交的BankIt，一个是用软件Sequin。用那种办法，根据不同的需要。 BankIt: (在线提交页面：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/index.html 1.适合单个或少量几个的提交 2.喜欢用在线的方式提交，无需下载个软件 3.你的序列的注释不复杂 4.提交你的序列时不需要用到序列的分析 Sequin（下载页面：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html） 1.提交的是批量而且比较复杂的序列 2.you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets 3.喜欢图形的界面，有更的选项和功能，可以批量修改 4.获得相关的分析工具 这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt，Sequin也是大同小异的。 1，进入GenBank 2，左栏点击Submit to GenBank 3，左边出现几个工具的选择，点击BankIt。在BankIt提交页面的最下面，填上你要提交的序列的长度，点New 4，点New后，会生成一个bankit号，记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊，序列之类的 5，填好资料后，你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误，点提交（Validate and continue） 6，如果你填的资料有误，或漏填了。就会有ERROR的提醒。像名字，电话，Email，序列等都是必须的。 最后NCBI会给您发个邮件，等过几个月后如果没有问题就能得到您的登录号了，如果有问题NCBI会邮件和您联系。如果是用Sequin，填好资料过程中可以随时保存，最后你只需把最后确认的文件向NCBI发封邮件就可以了。 |
2楼2009-10-09 15:43:38
09021122
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2064.5
- 红花: 1
- 沙发: 1
- 帖子: 518
- 在线: 113.5小时
- 虫号: 856621
- 注册: 2009-09-25
- 性别: GG
- 专业: 系统生物学
3楼2009-10-09 15:45:42
20