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alfabeta

新虫 (小有名气)

[交流] 有关NCBI提交序列的问题!急!!

我向NCBI提交序列,但反馈说需要提供organism source 和具体信息。请问这里的organism source是要说明它是哪个属和种的吗?可我做的是酵母菌鉴定,并不能确定它是具体的那个种的呀?
   换句话说是不是向NCBI提交序列需要知道这个菌株是那个种的。
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09021122

木虫 (正式写手)

向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用那种办法,根据不同的需要。
BankIt: (在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/index.html
1.适合单个或少量几个的提交
2.喜欢用在线的方式提交,无需下载个软件
3.你的序列的注释不复杂
4.提交你的序列时不需要用到序列的分析
Sequin(下载页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html

1.提交的是批量而且比较复杂的序列
2.you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets
3.喜欢图形的界面,有更的选项和功能,可以批量修改
4.获得相关的分析工具
这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt,Sequin也是大同小异的。

1,进入GenBank




2,左栏点击Submit to GenBank




3,左边出现几个工具的选择,点击BankIt。在BankIt提交页面的最下面,填上你要提交的序列的长度,点New



4,点New后,会生成一个bankit号,记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊,序列之类的



5,填好资料后,你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误,点提交(Validate and continue)


6,如果你填的资料有误,或漏填了。就会有ERROR的提醒。像名字,电话,Email,序列等都是必须的。



最后NCBI会给您发个邮件,等过几个月后如果没有问题就能得到您的登录号了,如果有问题NCBI会邮件和您联系。如果是用Sequin,填好资料过程中可以随时保存,最后你只需把最后确认的文件向NCBI发封邮件就可以了。
雄关漫道真如铁,而今迈步从头越
2楼2009-10-09 15:43:38
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09021122

木虫 (正式写手)

这是我转载别人的
雄关漫道真如铁,而今迈步从头越
3楼2009-10-09 15:45:42
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