应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 天然药物化学 » 分子对接 分子动力学相关
51/1返回列表
查看: 789  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

咖喱儿1

新虫 (小有名气)
已领完
分子对接 分子动力学相关
领取红包 (小木虫手机app专属红包)

扫一扫，下载小木虫客户端

求问一下大家采用autodock vina进行分子对接的时候，box将整个蛋白包裹进行对接，没有查找蛋白的活性位点，这种对接结果投文章的时候会有问题吗？如果要找蛋白的活性位点具体需要怎么找呢？配体所在位置即活性位点吗？如果一个蛋白有多个配体那是应该每个配体的位置都作为活性位点对接吗？第一次发帖求助，感谢大家！！

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2023-09-05 10:40:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18827515408

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
蛋白有多个活性位点，但是一把去对接结果中结合最低的那个位点即可，或者是打分分数最高的那个
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2023-09-07 19:26:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

aspect3000

至尊木虫 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
如果是pdb数据库里的 配体应该是活性位点

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2023-09-06 07:12:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

咖喱儿1

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by aspect3000 at 2023-09-06 07:12:55
如果是pdb数据库里的 配体应该是活性位点

谢谢回复！主要就是在纠结多配体的蛋白是不是要对接好多次还是全包裹也可以，还有就是没有配体的蛋白是不是只能全包裹。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2023-09-06 09:46:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
blwang10214楼
2023-09-05 10:46   回复  
咖喱儿1(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
XG-WUST3楼
2023-09-05 10:44   回复  
咖喱儿1(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫IOS客户端
Michael9892楼
2023-09-05 10:42   回复  
咖喱儿1(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
成长中的晴天6楼
2023-09-05 10:56   回复  
咖喱儿1(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
壹加工5楼
2023-09-05 10:52   回复  
咖喱儿1(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭