24小时热门版块排行榜    

查看: 881  |  回复: 5
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 yyx19840628 的 3 个金币

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

[交流] 【讨论】可不可以将几个protocal编到一个总的protocal里?

我做DS的时候想做一系列的计算,有点类似
simulation里面的标准动力学,最小化两次,退火,跑NVT,预平衡,跑NPT。这可以编写到一个protocal 里面吗

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 19:25 ]
回复此楼
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoyingnba

金虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不太明白你的意思,在simulation的protocol里面的standard Dynamics Cascade不就是你说的这个么
2楼2009-10-09 08:05:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

引用回帖:
Originally posted by guoyingnba at 2009-10-9 08:05:
不太明白你的意思,在simulation的protocol里面的standard Dynamics Cascade不就是你说的这个么

standard Dynamics Cascade里面是直接预优化然后就跑动力学,我想在预优化之后加一个NVT的弛豫。
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2009-10-09 08:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yyx19840628(金币+2,VIP+0):我也下了PP,请问具体怎么调用?麻烦不吝指教 10-9 09:24
Pipeline Pilot Client里面可以调啊
没具体操作过动力学的,不过其他的protocal试过,可以做
4楼2009-10-09 09:08:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2009-10-9 09:08:
Pipeline Pilot Client里面可以调啊
没具体操作过动力学的,不过其他的protocal试过,可以做

我也下了PP,请问具体怎么调用?麻烦不吝指教
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
5楼2009-10-09 09:23:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)

打开咯,我用的是Pipeline Pilot Client V6.1
进去里面有protocal,还有其他一系列的小操作整合成一个个小模块,你把那些从左边直接用鼠标拖到右边的大栏目里面就OK了。之后在那直接修改咯。操作很windows化得,试几下就会了。具体细节调的还是用的时候才好说,我也不知道该从哪说起
6楼2009-10-09 13:28:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yyx19840628 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-11 04:54 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-11 04:21 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:07 by Z7qfCsdIiD1T
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:01 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 03:59 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 03:56 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-11 01:24 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 22:39 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:12 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-10 01:29 by FChKX8meu1ds
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见