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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » check cif 中出现 A 类错误No s.u. Given for Flack Parameter
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)

[交流] check cif 中出现 A 类错误No s.u. Given for Flack Parameter

Alert level A
PLAT036_ALERT_1_A No s.u. Given for Flack Parameter ..............          ?

好像是缺少Flack参数，不知道怎么整？
No s.u. Given for Flack Parameter ..............          ?

No standard uncertainty found for the Flack parameter.
When the structure refinement was done with SHELXL97-2, the likely
reason for this is a missing BASF instruction. This applies in
particular when the associated Flack parameter has the value 0.000.
No valid conclusions on the absolute structure can be drawn.



我尝试过：
1. 如果有手性且有重原子，那在修正中加入Flack指令，修正后重新产生CIF。

2. 如果没有手性，或有手性但用Mo靶做小于Si元素的结构，则可在CIF的原子信息这一栏的最后面添加一句话，如下所示：

_chemical_formula_sum                  'C10 H18 O5 '
_chemical_formula_moiety               'C10 H18 O5 '
_chemical_formula_weight               218.25
_chemical_melting_point                ?
_chemical_absolute_configuration       ' unk '

还有这个：
1. 非手性分子但确定为手性空间群，同样要做Flack。注意此时的HKL数据应该是没有被平均过的。在shelx程序里面设置 MERG 3，或者重新评价数据选择不平均项。

2. 既非手性分子又不是手性空间群，checking程序是不会问这个问题的，不然就要再次检查空间群是否正确了。

3. 前述里的二点里一定有一处是对的，我已经尝试过上百遍了。

都没什么效果，请问还有其他方法吗？

[ Last edited by lijianghua2007 on 2009-10-8 at 21:18 ]
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淡泊名利，宁静致远。
1楼 2009-10-08 09:37:41
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
啥空间群啊?
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2楼2009-10-08 12:38:00
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zhousm

木虫 (正式写手)
被你逻辑搅晕了。
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3楼2009-10-08 14:22:25
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zhousm

木虫 (正式写手)
是说你的flack 参数x 没有偏差s.u.哦
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4楼2009-10-08 14:26:18
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by zhaoyangqufu at 2009-10-8 12:38:
啥空间群啊?

monoclinic
P21/c
赞一下 回复此楼
淡泊名利，宁静致远。
5楼2009-10-08 20:06:46
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)
★
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-9 10:47
引用回帖:
Originally posted by zhousm at 2009-10-8 14:26:
是说你的flack 参数x 没有偏差s.u.哦

就是No s.u. Given for Flack Parameter ，具体的也不太明白！
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淡泊名利，宁静致远。
6楼2009-10-08 20:08:34
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monoclinic

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
lijianghua2007(金币+4,VIP+0):谢谢你！你说对了！ 10-10 20:10
1. 该问题是说Flack值没有偏差，只要把偏差加上就好。

2. 奇怪的是 P 21/c 怎么可能有手性。把下面这行删除
_refine_ls_abs_structure_Flack      
或在后面加一个  “ ？” 都可以。
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2009-10-08 21:49:39
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zhousm

木虫 (正式写手)
P21/c?
怎么可能有手性，开玩笑吧
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8楼2009-10-08 22:22:23
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
★ ★
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-9 10:48
lijianghua2007(金币+1,VIP+0):辛苦了，你说得不太明白，有机会探讨！ 10-10 20:12
简单地修正往往导致Flack参数没有偏差，同时指定twin matrix即可以得到偏差值
赞一下(10人) 回复此楼
谋事在人，成事在天
9楼2009-10-08 22:33:57
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
如果精修时仅仅使用了一个光溜溜的twin，那么就会出现没有s.u.的情况。如果精修是使用这样的一对命令：
TWIN  1 0 0  0 -1 0  0 0 -1
BASF  0.5
Flack参数就给出偏差值。
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谋事在人，成事在天
10楼2009-10-10 23:16:39
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