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acerabc

新虫 (正式写手)

[交流] 离子化合物模型构建

想计算a分子的吉布斯自由能，构建了模型b，c是gauss优化后的结构，b中O和K以共价键形式连接了，实际O和K应该是以离子键形式连接，离子键应该怎么在模型体现出来？

离子化合物模型构建
a.png


离子化合物模型构建-1
b.png


离子化合物模型构建-2
c.png
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1楼 2023-07-06 13:46:07
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paramecium86

版主 (著名写手)
★
acerabc(金币+1): 谢谢参与
高斯的计算是真空中的结构 且电荷都是趋于平均化。也就是不太可能出现一个分子内有完整分离的阴阳离子对儿， 而是会算出让电荷平均化后的分子（真空中出现电离的等离子态本就是很困难的）。要想规定一边是阳离子一边是阴离子 那需要做Constrained DFT 这个NWchem这种程序支持。  如果是固体状态下的离子化合物，那应该用第一性原理的那些方法去计算了 而不是用高斯这类量子化学计算软件。   就高斯优化出来的这个结构是相对合理的。本来那个负电荷就是在两个O上平均分配的几乎。所以K应该要基本在这两个O中间其实没有什么问题。
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acerabc
5楼2023-07-07 10:28:28
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acerabc

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by paramecium86 at 2023-07-07 10:28:28
高斯的计算是真空中的结构 且电荷都是趋于平均化。也就是不太可能出现一个分子内有完整分离的阴阳离子对儿， 而是会算出让电荷平均化后的分子（真空中出现电离的等离子态本就是很困难的）。要想规定一边是阳离子一边 ...

老师您好，我想问一下如果我想计算萘甲酸和氢氧化钾反应生成萘甲酸钾和水这个反应的吉布斯自由能，是否可以用高斯分别优化这四个分子，分别得到他们的EE+thermal free energy correction，然后用萘甲酸钾和水的EE+thermal free energy correction减去萘甲酸和氢氧化钾的EE+thermal free energy correction。另如果反应条件为500℃的高温，反应物升温前是固体，我计算的机组为# b3lyp/6-311g(d,p) opt freq，这个设置是否还应该做什么改变？比如是否加色散矫正？是否因为反应物为固体而增加什么设置？
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6楼2023-07-07 19:40:15
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miaojiabing2楼
2023-07-06 17:36   回复  
acerabc(金币+1): 谢谢参与
tzynew3楼
2023-07-06 20:41   回复  
acerabc(金币+1): 谢谢参与
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chenhuanlong4楼
2023-07-06 22:54   回复  
acerabc(金币+1): 谢谢参与
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shenrenren7楼
2023-07-08 07:57   回复  
acerabc(金币+1): 谢谢参与
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