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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 天然药物化学 » 分离纯化的天然产物化合物活性很强，但是买回来的标准品却活性很弱，这是什么原因？
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小蔡66

新虫 (小有名气)

[交流] 分离纯化的天然产物化合物活性很强，但是买回来的标准品却活性很弱，这是什么原因？

各位前辈，小弟从一株细菌中分离鉴定了一个吡咯化合物，有很好的抗菌活性，查文献发现是已经能化学全合成的，然后在麦克林和阿拉丁上也能买到，回来做了液相，质谱，和核磁，数据都一致，结构上也没有手性，但是做抗菌活性的时候，发现自己分离的化合物在10mg/mL的浓度下活性依旧很强，买回来的样品没有活性，有一个细节，就是两个化合物的外观颜色不一样，买回来的标准品是白色固体，我自己分离的化合物是偏棕色的固体。大家有没有遇到这种情况。
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1楼2023-06-29 10:24:38
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

小灰灰92

木虫 (正式写手)
★
小蔡66(金币+1): 谢谢参与
两个样品平行再测一次活性，确认没有测错。如果还是这样，是不是你的样品有强活性杂质？用对照品测一下你的纯度有多少

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5楼2023-06-29 23:13:41
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aspect3000

至尊木虫 (知名作家)
★
小蔡66(金币+1): 谢谢参与
两个的样品核磁 色谱图一样？

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6楼2023-06-30 05:43:52
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netsking

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
可以从这几个方面考虑：1）买来的与分离是不是同一样品， 2）分离出来的化合物的纯度是多少？最好不要用UV-HPLC分析纯度，一定要用定量NMR来看。如果真要用UV－HPLC分析，就和190nm或201nm来分析样品。3）确保生物分析的结果可靠。这种情况会在天然产物分离中经常发生。一般这类被称为Residual Complexity. 有关这一话题可以参看这个link：https://gfp.people.uic.edu/rt/residualcomplexity.html。网页里有很详细的解释。
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7楼2023-07-04 01:04:16
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小蔡66

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by netsking at 2023-07-04 01:04:16
可以从这几个方面考虑：1）买来的与分离是不是同一样品， 2）分离出来的化合物的纯度是多少？最好不要用UV-HPLC分析纯度，一定要用定量NMR来看。如果真要用UV－HPLC分析，就和190nm或201nm来分析样品。3）确保生物分 ...

十分感谢。
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8楼2023-07-10 17:01:50
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小蔡66

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小灰灰92 at 2023-06-29 23:13:41
两个样品平行再测一次活性，确认没有测错。如果还是这样，是不是你的样品有强活性杂质？用对照品测一下你的纯度有多少

其实有个问题挺奇怪的，The EC50 values of compound 1H-pyrrole-2carboxylic acid  for S. sclerotiorum and P. capsici were 20 and 50 μg/ml，这是文献里面的一句话，文献里面也说有活性，我们自己做的也有，但是从试剂商那里买回来的样品就没有，奇了怪了。
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9楼2023-07-10 17:12:54
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水陌轻寒h

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
有没有可能买到的化合物本身有问题

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10楼2023-07-10 22:37:28
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是萌狐狸吖

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
可能是你的化合物不纯

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11楼2023-07-13 20:25:15
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miaojiabing2楼
2023-06-29 11:21   回复  
小蔡66(金币+1): 谢谢参与
XG-WUST3楼
2023-06-29 19:08   回复  
小蔡66(金币+1): 谢谢参与
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tzynew4楼
2023-06-29 22:50   回复  
小蔡66(金币+1): 谢谢参与
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