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xuqz

新虫 (初入文坛)

[求助] 计算化学小白关于使用gaussian和MS做吸附的一些基础问题想请教,请大家帮帮忙,感谢

大家好,我是计算化学小白,目前研二,课题开始较晚,有一些关于Gaussian和MS的基础问题想请教大家,十分感谢!因为涉及到MS软件,请版主审核时给小白一个机会,非常感谢!
我的方向是多孔材料(MOF、COF)吸附VOCs(苯、乙苯、苯乙烯等),目前我的想法是,通过gaussian计算吸附剂和吸附质的各个原子的电荷,然后在MS里通过设置力场和计算得到的电荷做吸附。我的问题是:
(1)若在gaussian中计算电荷,吸附剂和吸附质的模型是在GaussView中构建,还是在MS中构建然后提交到gaussian中计算比较合理?如果是在gaussview中构建的,如何保证在MS中做吸附时构建的模型和gaussview中构建的是一样的?
(2)接(1),提交到gaussian中去计算电荷的结构必须是优化之后与实际分子结构信息(键长、键角、二面角等)相差不大,还是只要保证结构中原子的数量和种类、原子之间键的数量和类型相符合就可以?
(3)通过学习sob老师的博文(https://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html)和原子电荷计算方法(https://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml)这篇文献,我的吸附剂结构(MOF、COF)设置为刚体,MK电荷和RESP电荷应该选择哪个更准确?对于吸附质(苯、乙苯、苯乙烯等)又该选择哪个电荷更准确?
(4)关于力场的选择:通过查阅文献,MOF因含有过渡金属,通常采用UFF力场,COF采用Dreiding力场,吸附质设置为与吸附剂相同的力场。MK电荷或者RESP电荷适用于这两种力场吗?
(5)假设我在MS中构建好了一个结构,想使用gaussian进行几何优化,优化之后再导入到MS进行后续吸附,如何实现两款软件的互相导入导出?
请各位大佬不吝赐教,谢谢大家!
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可口可太可

新虫 (初入文坛)

可以加个好友请教一下问题吗

发自小木虫IOS客户端
2楼2023-07-04 16:32:49
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晴空超越

新虫 (小有名气)

楼主,可以分享一下MS的下载软件吗?

发自小木虫Android客户端
3楼2023-09-20 13:40:05
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