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计算化学小白关于使用gaussian和MS做吸附的一些基础问题想请教，请大家帮帮忙，感谢
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大家好，我是计算化学小白，目前研二，课题开始较晚，有一些关于Gaussian和MS的基础问题想请教大家，十分感谢！因为涉及到MS软件，请版主审核时给小白一个机会，非常感谢！ 我的方向是多孔材料（MOF、COF）吸附VOCs（苯、乙苯、苯乙烯等），目前我的想法是，通过gaussian计算吸附剂和吸附质的各个原子的电荷，然后在MS里通过设置力场和计算得到的电荷做吸附。我的问题是： （1）若在gaussian中计算电荷，吸附剂和吸附质的模型是在GaussView中构建，还是在MS中构建然后提交到gaussian中计算比较合理？如果是在gaussview中构建的，如何保证在MS中做吸附时构建的模型和gaussview中构建的是一样的？ （2）接（1），提交到gaussian中去计算电荷的结构必须是优化之后与实际分子结构信息（键长、键角、二面角等）相差不大，还是只要保证结构中原子的数量和种类、原子之间键的数量和类型相符合就可以？ （3）通过学习sob老师的博文（https://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html）和原子电荷计算方法（https://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml）这篇文献，我的吸附剂结构（MOF、COF）设置为刚体，MK电荷和RESP电荷应该选择哪个更准确？对于吸附质（苯、乙苯、苯乙烯等）又该选择哪个电荷更准确？ （4）关于力场的选择：通过查阅文献，MOF因含有过渡金属，通常采用UFF力场，COF采用Dreiding力场，吸附质设置为与吸附剂相同的力场。MK电荷或者RESP电荷适用于这两种力场吗？ （5）假设我在MS中构建好了一个结构，想使用gaussian进行几何优化，优化之后再导入到MS进行后续吸附，如何实现两款软件的互相导入导出？ 请各位大佬不吝赐教，谢谢大家！ |
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2楼2023-07-04 16:32:49
晴空超越
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