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cjlcjl8592木虫 (著名写手)
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[交流]
如何使用Platon软件或者直接用shelxtl软件将低对称性的结构提高，请高人指教
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我有一个晶体，我用单斜Pn空间群，可以很顺利解析出来，但我认为对称性选的太低，结果使用Checkcif检查，提示晶体对称性应该为P21/c, 用Platon软件检查也提示对称性应该是P21/n，但我直接用P21/c去解析却发现解析不出来，不知为什么？ 请高手帮忙，我需要如何做？谢谢！ |
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4楼2009-09-29 09:22:07
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5楼2009-09-29 17:26:02
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一些具体的晶体参数： _symmetry_cell_setting Monoclinic _symmetry_space_group_name_H-M Pn loop_ _symmetry_equiv_pos_as_xyz 'x, y, z' 'x+1/2, -y, z+1/2' _cell_length_a 9.602(5) _cell_length_b 18.668(8) _cell_length_c 14.827(7) _cell_angle_alpha 90.00 _cell_angle_beta 101.250(5) _cell_angle_gamma 90.00 _cell_volume 2607(2) _cell_formula_units_Z 2 _cell_measurement_temperature 293(2) _cell_measurement_reflns_used ? _cell_measurement_theta_min ? _cell_measurement_theta_max ? _exptl_crystal_description ? _exptl_crystal_colour ? _exptl_crystal_size_max ? _exptl_crystal_size_mid ? _exptl_crystal_size_min ? _exptl_crystal_density_meas ? _exptl_crystal_density_diffrn 1.513 _exptl_crystal_density_method 'not measured' _exptl_crystal_F_000 1200 _exptl_absorpt_coefficient_mu 2.456 _exptl_absorpt_correction_type none _exptl_absorpt_correction_T_min ? _exptl_absorpt_correction_T_max ? _exptl_absorpt_process_details ? _exptl_special_details ; ? ; _diffrn_ambient_temperature 293(2) _diffrn_radiation_wavelength 0.71073 _diffrn_radiation_type MoK\a _diffrn_radiation_source 'fine-focus sealed tube' _diffrn_radiation_monochromator graphite _diffrn_measurement_device_type 'Bruker P4' _diffrn_measurement_method '\w scans' _diffrn_detector_area_resol_mean ? _diffrn_standards_number ? _diffrn_standards_interval_count ? _diffrn_standards_interval_time ? _diffrn_standards_decay_% ? _diffrn_reflns_number 21217 _diffrn_reflns_av_R_equivalents 0.0232 _diffrn_reflns_av_sigmaI/netI 0.0342 _diffrn_reflns_limit_h_min -12 _diffrn_reflns_limit_h_max 12 _diffrn_reflns_limit_k_min -19 _diffrn_reflns_limit_k_max 24 _diffrn_reflns_limit_l_min -19 _diffrn_reflns_limit_l_max 19 _diffrn_reflns_theta_min 2.18 _diffrn_reflns_theta_max 27.29 _reflns_number_total 10650 _reflns_number_gt 8927 _reflns_threshold_expression >2sigma(I) _computing_data_collection 'Bruker XSCANS' _computing_cell_refinement 'Bruker XSCANS' _computing_data_reduction 'Bruker SHELXTL' _computing_structure_solution 'SHELXS-97 (Sheldrick, 1990)' _computing_structure_refinement 'SHELXL-97 (Sheldrick, 1997)' _computing_molecular_graphics 'Bruker SHELXTL' _computing_publication_material 'Bruker SHELXTL' _refine_ls_structure_factor_coef Fsqd _refine_ls_matrix_type full _refine_ls_weighting_scheme calc _refine_ls_weighting_details 'calc w=1/[\s^2^(Fo^2^)+(0.0758P)^2^+0.6775P] where P=(Fo^2^+2Fc^2^)/3' _atom_sites_solution_primary direct _atom_sites_solution_secondary difmap _atom_sites_solution_hydrogens geom _refine_ls_hydrogen_treatment mixed _refine_ls_extinction_method SHELXL _refine_ls_extinction_coef 0.0050(8) _refine_ls_extinction_expression 'Fc^*^=kFc[1+0.001xFc^2^\l^3^/sin(2\q)]^-1/4^' _refine_ls_abs_structure_details 'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881' _refine_ls_abs_structure_Flack 0.00 _refine_ls_number_reflns 10650 _refine_ls_number_parameters 659 _refine_ls_number_restraints 2 _refine_ls_R_factor_all 0.0539 _refine_ls_R_factor_gt 0.0440 _refine_ls_wR_factor_ref 0.1271 _refine_ls_wR_factor_gt 0.1176 _refine_ls_goodness_of_fit_ref 1.072 _refine_ls_restrained_S_all 1.072 _refine_ls_shift/su_max 0.000 _refine_ls_shift/su_mean 0.000 _diffrn_measured_fraction_theta_max 0.994 _diffrn_reflns_theta_full 27.29 _diffrn_measured_fraction_theta_full 0.994 _refine_diff_density_max 0.705 _refine_diff_density_min -0.622 _refine_diff_density_rms 0.132 |
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