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bbslover金虫 (正式写手)
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[交流]
【讨论】计算的描述符，如何在paper中讨论？
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2D-QSAR需计算一些描述符，从中选取与活性最相关的一些来进行讨论，可是描述符有很多，如何根据所选的描述符进行深入讨论呢？ 我看很多paper都是很肤浅的讨论了一下，介绍一下定义等等，很少深入的，现在看来这样做是不行的，呵呵，必须深入讨论，那么该参考那些资料来讨论呢？不同的software可以算的descriptors也不同，难道就参考软件本省的资料吗？ 高手请解惑。 [ Last edited by zdhlover on 2009-11-13 at 19:15 ] |
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yalefield
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目前，描述符的种类非常多，不完全统计，可能超过两千种，大致可以分为物理化学、量子化学、拓扑指数、立体方面等等。而这也造成了2D-QSAR的结果不容易解释。 换句话说，即使你的模型，经过种种操作，最后用到了8个描述子，你又如何解释这8个变量的作用？ 因此，虽说搞清楚每个描述子的含义，的确是应该做的，但对于2D-QSAR来说，其实描述子的含义并没有什么可说的，除非你就用了两、三个描述子。 前几年的论文情况，基本上是比拼谁能拿到看起来更好的模型，而不太关心模型的应用（例如，模型的预测能力、健壮性、多模型共识、应用域等）。 3D-QSAR，在这方面似乎好些，因为2D-QSAR的描述子基本上都是来自分子的“全局的”，而3D-QSAR则更关心分子的“局部”，这样还比较好解释。 [ Last edited by yalefield on 2009-9-27 at 21:14 ] |
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bbslover
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