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森林7631

铜虫 (小有名气)

[交流] 测序结果分析

我的一个基因送去测序,测序结果回来比对竟然引物都找不到,重新拼接后还是没有,猜想是突变了,查找引物中的5-6个碱基却在一个反应的测序结果中查找到了,这样的结果还可信不,刚接触到这方面,还请各位多多指导,谢了啊
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Time lost can not be recalled.
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森林7631

铜虫 (小有名气)

都整过了,就是找不到,我的序列大概1300个碱基,两个反应,后来只查找引物中的几个却在同一个反应的测序结果中查找到,与原引物对比其中一个是2个碱基不同,另一个则好多,
Time lost can not be recalled.
3楼2009-09-26 21:40:45
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
将测序结果反向或者互补之后再重新比对试试。
2楼2009-09-26 21:15:06
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你的引物有多长,是不是特异性不好?
5楼2009-09-26 23:30:57
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gastrodia

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
Blast了没有,若是送PCR产物测序的,找不到引物是很正常的,因为从测序引物开始后的50bp左右的碱基通常都读不出来,如果是克隆测序找不到引物,重做吧
6楼2009-09-27 09:07:06
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