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staphlee金虫 (正式写手)
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[交流]
(幫幫我吧)用.lst中找到"Default effective X-H distances"来加氢的问题
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请教各位...如果我想要利用Q峰加氢.... 在Muller的书中提到是用以下方法: 1.在.res or .ins中找到适当的Q峰...然后贴到他们对应相接的原子的正下方 2.把Q峰的名字改为Hn...其中n为编号...和把原子的形式改为氢 3.要restrain XH...在.lst中找到"Default effective XH distances"然后输入相对应的键长即可...指令如下 DFIX # X Hn (其中#是在3.里面找到的相对应键长...X是对应接氢的原子...Hn是氢的标号) Default effective X-H distances for T = -173.5 C AFIX m = 1 2 3 4 4[N] 3[N] 15[B] 8[O] 9 9[N] 16 d(XH) = 1.00 0.99 0.98 0.95 0.88 0.91 1.12 0.84 0.95 0.88 0.95 我的问题是... 1.这个表有时后找不到...是为什么呢? 2.这个表要怎样看???为何会有好几个N的相对应键长...如4[N],3[N],... 要看哪一個?? 3.每次用上述的方法用Q峰加氢完之后,是不是都需要用DFIX规范一下键长...这样的指令用法是对的嘛?? 4.这样的方法适用于把氢加在任何的原子上嘛??如C,O,N?? 请高手讨论一下...相信这个对新手有一定的帮助...谢谢 [ Last edited by staphlee on 2009-9-27 at 12:32 ] |
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谢谢你的回应阿....可是我有问题... 1.你说的""限制原子与Hn的距离""...这个指令要怎样用?? 2."，距离是按照公认的XH距离，很多资料上都有"...哪些资料呢?可以讲一下嘛? 3.我上面的那个表(下表)...该怎么解读怎么用呢?? Default effective X-H distances for T = -173.5 C AFIX m = 1 2 3 4 4[N] 3[N] 15[B] 8[O] 9 9[N] 16 d(XH) = 1.00 0.99 0.98 0.95 0.88 0.91 1.12 0.84 0.95 0.88 0.95 例如我要NH,但为何会有好几个N的相对应键长...如4[N],3[N],...要看哪一个?? |
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