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sai00fuji金虫 (正式写手)
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请教如何确定DNA探针
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研一新手什么都不懂，导师选了小课题给我。是某类药材的DNA鉴定。 想请教该怎样入手呢？ 怎样确定DNA探针（倾向于使用线粒体DNA），怎样选取合适引物？ 看论文，有句话是“线粒体细胞色素b基因（cyt b）早已作为蟾蜍科动物的一个分类学依据”。想知道怎样找到类似的分类依据？ “在前期工作中，采用蟾蜍科特异性引物MVZ 28和MVZ 43，对三种蟾蜍（中华大蟾蜍，黑眶蟾蜍，花背蟾蜍）的cyt b基因片段进行高特异性PCR扩增，分别得到460bp的DNA片段，对所得DNA条码进行限制性内切酶位点分析，发现在不同物种的DNA条码内存在不同的限制性位点”怎样找特异性引物呢？ 谢谢高手赐教！！ |
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sai00fuji
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3楼2009-09-24 19:23:52
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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1、你拿探针做什么？ 2、怎样选择引物：特异性引物是根据你的目的基因（target gene）设计的，需要用到生物学软件，有很多软件和论文来辅助你设计，这个你可能需要系统学一下。当然也不难。 3、分类学依据：这个工作貌似工作量比较大。我的理解是cytB作为分类学依据是因为其在不同的种或科中具有特异性，就是说这个基因在同一个种或科中是高度保守的，但在不同的种和科之间是有差异的，这样才能作为分类依据。如果你想找这种分类依据的话，需要对各个物种进行测序，或利用生物信息学，在已有的数据中发现这种有用数据。不过，不管从哪个方面，这好像都不是个小课题啊。 |
2楼2009-09-24 19:06:27
