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sai00fuji

金虫 (正式写手)

[交流] 请教如何确定DNA探针

研一新手什么都不懂,导师选了小课题给我。是某类药材的DNA鉴定。

想请教该怎样入手呢?

怎样确定DNA探针(倾向于使用线粒体DNA),怎样选取合适引物?

看论文,有句话是“线粒体细胞色素b基因(cyt b)早已作为蟾蜍科动物的一个分类学依据”。想知道怎样找到类似的分类依据?

“在前期工作中,采用蟾蜍科特异性引物MVZ 28和MVZ 43,对三种蟾蜍(中华大蟾蜍,黑眶蟾蜍,花背蟾蜍)的cyt b基因片段进行高特异性PCR扩增,分别得到460bp的DNA片段,对所得DNA条码进行限制性内切酶位点分析,发现在不同物种的DNA条码内存在不同的限制性位点”怎样找特异性引物呢?

谢谢高手赐教!!
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hamye

铁虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1、你拿探针做什么?
2、怎样选择引物:特异性引物是根据你的目的基因(target gene)设计的,需要用到生物学软件,有很多软件和论文来辅助你设计,这个你可能需要系统学一下。当然也不难。
3、分类学依据:这个工作貌似工作量比较大。我的理解是cytB作为分类学依据是因为其在不同的种或科中具有特异性,就是说这个基因在同一个种或科中是高度保守的,但在不同的种和科之间是有差异的,这样才能作为分类依据。如果你想找这种分类依据的话,需要对各个物种进行测序,或利用生物信息学,在已有的数据中发现这种有用数据。不过,不管从哪个方面,这好像都不是个小课题啊。
2楼2009-09-24 19:06:27
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sai00fuji

金虫 (正式写手)

不知道啊,老师就是说只要选出引物就好做了,还说这学期做完……
~~~~(>_<~~~~
弱弱的问一句,是先确定探针还是先选引物啊?
那个目的基因是?

偶还处于看书阶段,可是还是米有一点头绪,高手教教我啊
3楼2009-09-24 19:23:52
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