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草铭1943

禁虫 (正式写手)

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MEGA建立进化树的方法

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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)


草铭1943(金币+1,VIP+0):一看就是高手,就是可惜我是只菜鸟,看不懂,不过还是多谢你的热情帮助 9-25 19:28
首先应该去处嵌合体,然后通过CLUSTAL X比对,对结果用mega 4或phylip成图校正参数用K-2 或J-C,用dotur算出OTU,文库之间的进化树用-LIBSHUFF进行分析。
9楼2009-09-25 14:32:20
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蓝色基因

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
先在NCBI上blast你自己细菌的16S,寻找相近的菌株的16S序列。

再用clustalx1.8做系统发育树,再用mega 3成图。
2楼2009-09-24 10:41:44
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草铭1943

禁虫 (正式写手)

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3楼2009-09-24 10:49:10
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MellonCHEN

银虫 (小有名气)

你可以点击察看一下该菌株是否被发表,或是录用。通常情况下,优先考虑已经发表的菌株作为参考。
4楼2009-09-24 11:48:51
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