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草铭1943

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MEGA建立进化树的方法

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1楼 2009-09-24 10:30:16
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蓝色基因

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
先在NCBI上blast你自己细菌的16S,寻找相近的菌株的16S序列。

再用clustalx1.8做系统发育树，再用mega 3成图。
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2楼2009-09-24 10:41:44
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草铭1943

禁虫 (正式写手)
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3楼2009-09-24 10:49:10
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MellonCHEN

银虫 (小有名气)
你可以点击察看一下该菌株是否被发表，或是录用。通常情况下，优先考虑已经发表的菌株作为参考。
赞一下 回复此楼
4楼2009-09-24 11:48:51
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草铭1943

禁虫 (正式写手)
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5楼2009-09-24 14:17:22
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charon1982

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
草铭1943(金币+1,VIP+0):谢谢了，学习中 9-24 16:58
草铭1943(金币+1,VIP+0):16S已下载，多谢 9-24 21:45
请搜索我的一个帖子，怎么找模式种
赞一下(5人) 回复此楼
帮助虫友，提升自己
6楼2009-09-24 15:43:56
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草铭1943

禁虫 (正式写手)
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7楼2009-09-24 21:45:18
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草铭1943

禁虫 (正式写手)
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8楼2009-09-25 11:47:10
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)
★
草铭1943(金币+1,VIP+0):一看就是高手，就是可惜我是只菜鸟，看不懂，不过还是多谢你的热情帮助 9-25 19:28
首先应该去处嵌合体,然后通过CLUSTAL X比对,对结果用mega 4或phylip成图校正参数用K-2 或J-C，用dotur算出OTU，文库之间的进化树用-LIBSHUFF进行分析。
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2009-09-25 14:32:20
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草铭1943

禁虫 (正式写手)
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10楼2009-09-25 19:31:24
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