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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】在CASTEP中如何把一个原子替换成不带电的空球

在一篇文献中看到在SrTiO3中进行electron doped。文中用empty spheres 替换了O原子。原文是这样的:We study the oxygen deficiency by replacing oxygen atoms in this supercell by empty spheres.
请问,在MS中画图时如何得到这个empty spheres?或者说如何把O原子用empty spheres替换掉?
在modify——modify elements中试过,都是周期表中的元素。
是否对某一个原子的质量和电荷进行某种修改能够得到empty spheres,从而实现electron doped?能否提供有关electron doped更详细的介绍?谢谢!!!
有虫友给出emperty spheres就是空位的回复,这好像不对。空位是vacancies,直接delete该原子就能得到。而empty spheres在超胞中仍然是存在的,并且可以计算出它的DOS。希望高手给予指点!谢谢!!!

[ Last edited by laohaoren2802 on 2009-10-21 at 15:17 ]
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redskywei

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5,VIP+0):thank you very much 10-26 18:26
laohaoren2802(金币+2,VIP+0):谢谢! 10-30 12:31
引用回帖:
Originally posted by laohaoren2802 at 2009-10-26 12:33:

想问下,在Castep中空位半径内的DOS怎样做出来呢?已经被Delete了,没法选中了?还是空位DOS有其他的做法?请给予指教!!!谢谢!!!

我只能从概念上说,某点的态密度就可以看做该点的局域态密度。空位位置虽然没有原子,但是也可以有态密度的,具体他们怎么把那个地方的态密度搞出来我无从猜测,很多开源的程序都可以,castep在英国就是免费的开源软件。呵呵。
我大体瞄了一下你说的文献,5个图里没有提到空位处的dos,也就是我说的局域密度(一般缩写LDOS)。他的结果都是关于超胞的原子轨道投影密度,也就是PDOS。氧的都是2p轨道的PDOS。随意我想他是直接把超胞中氧在2p轨道的投影DOS画出来的吧。再具体到软件问题,俺们想只有问作者了。他那程序好像是自己写的哦。

[ Last edited by redskywei on 2009-10-26 at 15:06 ]
坠入无边的网~~
16楼2009-10-26 15:05:20
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stou

银虫 (小有名气)

★ ★
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 9-24 22:10
laohaoren2802(金币+1,VIP+0):谢谢 9-25 09:28
electron doped的意思应该就是n型掺杂吧,emperty spheres不就是空位么?那只要建立一个超胞,把里面的O原子去掉不就可以实现空位取代了么?

个人理解
2楼2009-09-24 09:55:08
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流2 10-25 16:25
引用回帖:
Originally posted by stou at 2009-9-24 09:55:
electron doped的意思应该就是n型掺杂吧,emperty spheres不就是空位么?那只要建立一个超胞,把里面的O原子去掉不就可以实现空位取代了么?

个人理解

在MS里试过,当你在超胞里把O原子去掉时,该O原子形成的相关键也都被去掉了。这样该超胞距不完整了。是不是我去掉的方法不对?(选中O原子,直接Delete)有没有其他去除方法?请指教!!谢谢!!
3楼2009-09-24 10:04:04
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liusanbing

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 9-24 22:10
laohaoren2802(金币+1,VIP+0):谢谢 9-25 09:28
laohaoren2802(金币+1,VIP+0):谢谢 9-25 09:28
当你在超胞里把O原子去掉时,该O原子形成的相关键也都被去掉了,这是显示的设置问题
4楼2009-09-24 10:10:02
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