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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】在CASTEP中如何把一个原子替换成不带电的空球
汕头大学海洋科学接受调剂
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】在CASTEP中如何把一个原子替换成不带电的空球

在一篇文献中看到在SrTiO3中进行electron doped。文中用empty spheres 替换了O原子。原文是这样的：We study the oxygen deficiency by replacing oxygen atoms in this supercell by empty spheres.
请问，在MS中画图时如何得到这个empty spheres？或者说如何把O原子用empty spheres替换掉？
在modify——modify elements中试过，都是周期表中的元素。
是否对某一个原子的质量和电荷进行某种修改能够得到empty spheres，从而实现electron doped？能否提供有关electron doped更详细的介绍？谢谢！！！
有虫友给出emperty spheres就是空位的回复，这好像不对。空位是vacancies，直接delete该原子就能得到。而empty spheres在超胞中仍然是存在的，并且可以计算出它的DOS。希望高手给予指点！谢谢！！！

[ Last edited by laohaoren2802 on 2009-10-21 at 15:17 ]
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1楼 2009-09-23 21:57:45
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liusanbing

铜虫 (正式写手)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 9-24 22:10
laohaoren2802(金币+1,VIP+0):谢谢 9-25 09:28
laohaoren2802(金币+1,VIP+0):谢谢 9-25 09:28
当你在超胞里把O原子去掉时，该O原子形成的相关键也都被去掉了，这是显示的设置问题
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4楼2009-09-24 10:10:02
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stou

银虫 (小有名气)
★ ★
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 9-24 22:10
laohaoren2802(金币+1,VIP+0):谢谢 9-25 09:28
electron doped的意思应该就是n型掺杂吧，emperty spheres不就是空位么？那只要建立一个超胞，把里面的O原子去掉不就可以实现空位取代了么？

个人理解
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2楼2009-09-24 09:55:08
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流2 10-25 16:25
引用回帖:
Originally posted by stou at 2009-9-24 09:55:
electron doped的意思应该就是n型掺杂吧，emperty spheres不就是空位么？那只要建立一个超胞，把里面的O原子去掉不就可以实现空位取代了么？

个人理解

在MS里试过，当你在超胞里把O原子去掉时，该O原子形成的相关键也都被去掉了。这样该超胞距不完整了。是不是我去掉的方法不对？（选中O原子，直接Delete）有没有其他去除方法？请指教！！谢谢！！
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3楼2009-09-24 10:04:04
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 10-25 16:25
引用回帖:
Originally posted by liusanbing at 2009-9-24 10:10:
当你在超胞里把O原子去掉时，该O原子形成的相关键也都被去掉了，这是显示的设置问题

那是不是可以理解为，去掉的只是O原子，相关键仍然存在只是没有显示出来？被去掉的O原子位置用什么来填充可以得到empty spheres？还是不用填充，让它空缺就行了？谢谢！！！
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5楼2009-09-24 12:15:11
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