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kwkw

木虫 (著名写手)

[交流] ISSR-PCR?

有人做ISSR-PCR出过吗?我看ISSR好像都扩出10-20条带,可我最好的时候只扩出8、9条带,而现在只出一条带还只有200bp左右,谁出现过这种情况,如何解决的?我用同一引物扩不同的样品(同种),用不同引物(ISSR)扩同一样品,四个产物差不了10bp,但还是不一样大的,问一下高手,这是什么原因?我应该改一下哪个因素?那个梯度PCR仪有一个封片断了一点,密封性差一点会影响实验结果吗?
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695

木虫 (职业作家)


kwkw(金币+1):谢谢参与
正常了吧,材料不一样,结果也会不一样,统计标准不一样,结果也不一样的,只要结果差不多就行了,我当时AFLP也遇到过这样的问题
2楼2009-09-23 22:12:44
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kwkw

木虫 (著名写手)

不是,我现在还在做预实验,一条ISSR引物就扩出一条带,这应该是不正常的。我想知道这是什么原因?别人做都是特异性差,我这特异性也太强了吧?
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3楼2009-09-24 07:48:55
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zxhong

金虫 (正式写手)


kwkw(金币+1):谢谢参与
lz能否帮忙列一下ISSR所用药品,并麻烦告知作ISSR的目的是?
4楼2009-09-24 08:39:02
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kwkw

木虫 (著名写手)

PCR反应体系:10×buffer  TAQ酶 dNTP 单引物  总DNA .目的是用微卫星重复序列作为引物来扩增两个微卫星之间的序列,研究生物的遗传多样性
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5楼2009-09-24 17:12:38
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louyiceng

荣誉版主 (知名作家)

优秀版主


kwkw(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by kwkw at 2009-09-24 17:12:38:
PCR反应体系:10×buffer  TAQ酶 dNTP 单引物  总DNA .目的是用微卫星重复序列作为引物来扩增两个微卫星之间的序列,研究生物的遗传多样性

谢谢
6楼2010-03-15 07:55:06
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eesing

金虫 (正式写手)


kwkw(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
1楼: Originally posted by kwkw at 2009-09-23 21:45:23:
有人做ISSR-PCR出过吗?我看ISSR好像都扩出10-20条带,可我最好的时候只扩出8、9条带,而现在只出一条带还只有200bp左右,谁出现过这种情况,如何解决的?我用同一引物扩不同的样品(同种),用不同引物(ISSR)扩同一 ...

现在楼主做出来了吗?我也在做发现同一次三个一样的pcr体系,扩增出来结果有显著差异,不知lz有一样的情况吗?如何解决的呢?还有就是背景有点亮,像是抹带,望指点,谢谢
7楼2011-08-17 07:45:46
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