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rencuihuan_0212

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】求助团簇模型的优化问题

团簇模型模拟固体表面的吸附，gview画出团簇模型后有氢原子封闭，在高斯中优化想得到稳定结构，但结果总是团簇中被吸附原子（没有加氢）之间形成化学键，得不到想要的团簇结构。不知道问题出在那里，请高手指教。

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1楼2009-09-23 20:37:22

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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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rencuihuan_0212(金币+2,VIP+0):谢谢！ 9-27 13:28
gwdavid(金币+10,VIP+0):呵呵，辛苦你啦！ 9-27 15:39

今天正好周日有空，就叨叨两句吧，给出的全是良心的建议，当然听不听，看楼主自己的意愿了。

第一个问题：关于形成了化学键。
首先你要知道一点，化学键不是看GV的。

有人以为GV在两个原子之间画了一根棍儿，那就是有化学键，GV没有在两个原子之间画棍儿，那就是没有化学键，这个想法是极其错误的。
具体可参看这个帖子的问题（3.1）号：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146&fpage=1

第二个问题：关于你的方法

b3lyp不适合氢键作用力和长程作用力。你做表面吸附，有一个从远到近的过程，其中必定有长程作用，所以用b3lyp不合适。你需要优选一个方法。优选方法，在JPCA 2007 111 10439-10452这个文章中有详述

第三个问题：关于你的基组

3-21g绝对不合适。这个基组很低，而且适合处理化学键的作用，而不适合处理氢键、远程作用。处理氢键作用，一般要在氢原子上加一两组p轨道，如果加上一组d轨道会更好。处理远程作用，最好能在重原子上加弥散函数。
其实高斯型基函，处理远程作用本来就是弱项。但是我基本不做远程作用，我知道didz/劈裂价键基组/mg3s这3个基函的组合，适合远程作用来着，但是它们怎么组合的，忘了，你再查查文献吧

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-9-27 at 16:27 ]