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wargod2008

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请问下面的图是用什么软件模拟的,多谢!

小弟是学高分子的,研究方向是多肽的自组装行为,经常看到文章上模拟出来的漂亮的图片,我自己的文章想用这些搞图片,但是不知道该怎么搞?我简单看了一下这个版块的介绍,常用的模拟软件有NAMD等,不知道这个软件从哪里可以下载到或者买到.恳求这个版内的兄弟姐妹们给个建议。下面一片Advanced materials上的一篇文章给出的模拟图,作者说是用Amber forcefield来优化的,完全彻底不懂,希望得到大家的帮助,多谢了!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:42 ]
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★
wargod2008(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):谢谢bay专家 10-1 11:20
这个vmd 是可以的,
vmd 是namd 的姐妹软件,由同一个研究小组编写。
namd 负责计算,vmd 负责建模,数据处理和可视化,这两个软件以实现无缝链接。
这两个都是开源,免费软件

vmd下载
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
vmd作图的几个例子
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/spotlight/
小木虫关于namd/vmd 的在线答疑贴
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1308637

[ Last edited by bay__gulf on 2009-10-1 at 08:47 ]
2楼2009-10-01 08:44:48
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