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wargod2008金虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】请问下面的图是用什么软件模拟的,多谢!
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小弟是学高分子的,研究方向是多肽的自组装行为,经常看到文章上模拟出来的漂亮的图片,我自己的文章想用这些搞图片,但是不知道该怎么搞?我简单看了一下这个版块的介绍,常用的模拟软件有NAMD等,不知道这个软件从哪里可以下载到或者买到.恳求这个版内的兄弟姐妹们给个建议。下面一片Advanced materials上的一篇文章给出的模拟图,作者说是用Amber forcefield来优化的,完全彻底不懂,希望得到大家的帮助,多谢了! [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:42 ] |
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bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
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wargod2008(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):谢谢bay专家 10-1 11:20
wargod2008(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):谢谢bay专家 10-1 11:20
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这个vmd 是可以的, vmd 是namd 的姐妹软件,由同一个研究小组编写。 namd 负责计算,vmd 负责建模,数据处理和可视化,这两个软件以实现无缝链接。 这两个都是开源,免费软件 vmd下载 http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ vmd作图的几个例子 http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/spotlight/ 小木虫关于namd/vmd 的在线答疑贴 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1308637 [ Last edited by bay__gulf on 2009-10-1 at 08:47 ] |
2楼2009-10-01 08:44:48












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